SOX11

SOX11
Ідентифікатори
Символи SOX11, MRD27, SRY-box 11, CSS9, SRY-box transcription factor 11
Зовнішні ІД OMIM: 600898 MGI: 98359 HomoloGene: 37733 GeneCards: SOX11
Пов'язані генетичні захворювання
autosomal dominant non-syndromic intellectual disability 27[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
GO:0001105 transcription coactivator activity
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
translation factor activity, RNA binding
GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding
GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding

Клітинна компонента

цитоплазма
клітинне ядро

Біологічний процес

embryonic skeletal system morphogenesis
skeletal system development
noradrenergic neuron differentiation
positive regulation of lens epithelial cell proliferation
диференціація клітин
cardiac ventricle formation
glial cell development
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
limb bud formation
lung morphogenesis
sympathetic nervous system development
neural crest cell development
розвиток нирки
negative regulation of glial cell proliferation
soft palate development
ventricular septum morphogenesis
cornea development in camera-type eye
outflow tract morphogenesis
positive regulation of ossification
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
negative regulation of cell death
transcription by RNA polymerase II
eyelid development in camera-type eye
negative regulation of gene expression
negative regulation of lymphocyte proliferation
somite development
transcription, DNA-templated
neuroepithelial cell differentiation
regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway
нейробіологія розвитку
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
positive regulation of hippo signaling
positive regulation of neurogenesis
multicellular organism development
GO:1901313 positive regulation of gene expression
positive regulation of osteoblast differentiation
lens morphogenesis in camera-type eye
negative regulation of transcription regulatory region DNA binding
hard palate development
positive regulation of neuron differentiation
neuron differentiation
positive regulation of cell population proliferation
spinal cord development
positive regulation of BMP signaling pathway
glial cell proliferation
skeletal muscle cell differentiation
embryonic digestive tract morphogenesis
oligodendrocyte development
проліферація
positive regulation of stem cell proliferation
neural tube formation
positive regulation of hormone secretion
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
closure of optic fissure
Біосинтез білків

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
6664
20666
Ensembl
ENSG00000176887
ENSMUSG00000063632
UniProt
P35716
Q7M6Y2
RefSeq (мРНК)
NM_003108
NM_009234
RefSeq (білок)
NP_003099
NP_033260
Локус (UCSC) Хр. 2: 5.69 – 5.7 Mb Хр. 12: 27.38 – 27.39 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

SOX11 (англ. SRY-box 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 441 амінокислот, а молекулярна маса — 46 679[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MVQQAESLEAESNLPREALDTEEGEFMACSPVALDESDPDWCKTASGHIK
RPMNAFMVWSKIERRKIMEQSPDMHNAEISKRLGKRWKMLKDSEKIPFIR
EAERLRLKHMADYPDYKYRPRKKPKMDPSAKPSASQSPEKSAAGGGGGSA
GGGAGGAKTSKGSSKKCGKLKAPAAAGAKAGAGKAAQSGDYGGAGDDYVL
GSLRVSGSGGGGAGKTVKCVFLDEDDDDDDDDDELQLQIKQEPDEEDEEP
PHQQLLQPPGQQPSQLLRRYNVAKVPASPTLSSSAESPEGASLYDEVRAG
ATSGAGGGSRLYYSFKNITKQHPPPLAQPALSPASSRSVSTSSSSSSGSS
SGSSGEDADDLMFDLSLNFSQSAHSASEQQLGGGAAAGNLSLSLVDKDLD
SFSEGSLGSHFEFPDYCTPELSEMIAGDWLEANFSDLVFTY

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація, нейрогенез. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Goze C., Poulat F., Berta P. (1993). Partial cloning of SOX-11 and SOX-12, two new human SOX genes. Nucleic Acids Res. 21: 2943—2943. PMID 8332506 DOI:10.1093/nar/21.12.2943

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з SOX11 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11191 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
  5. UniProt, P35716 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 2
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші