SPTBN4 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SPTBN4, QV, SPNB4, SPTBN3, spectrin beta, non-erythrocytic 4, CMND, NEDHND |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606214 MGI: 1890574 HomoloGene: 11879 GeneCards: SPTBN4 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • phosphatase binding • spectrin binding • structural constituent of cytoskeleton • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ankyrin binding • actin binding • phospholipid binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • PML body • spectrin • мембрана • cell body fiber • nuclear matrix • Адгезивні контакти • клітинна мембрана • node of Ranvier • аксон • neuronal cell body • cell cortex • аксонний горбик • axon initial segment • paranode region of axon • екзосома • цитоскелет • intercalated disc |
---|
Біологічний процес | • clustering of voltage-gated sodium channels • аксоноґенеза • regulation of sodium ion transport • transmission of nerve impulse • слух • negative regulation of heart rate • MAPK cascade • axon guidance • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • розмножувальний процес • adult behavior • cardiac conduction • regulation of peptidyl-serine phosphorylation • actin filament capping • positive regulation of multicellular organism growth • запліднення • central nervous system projection neuron axonogenesis • vesicle-mediated transport • adult walking behavior • protein localization to plasma membrane • regulation of molecular function • cytoskeleton organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_001199234 NM_001199235 NM_001199236 NM_032610 |
|
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 40.47 – 40.58 Mb | Хр. 7: 27.06 – 27.15 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SPTBN4 (англ. Spectrin beta, non-erythrocytic 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 564 амінокислот, а молекулярна маса — 288 985[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAQVPGEVDN | | MEGLPAPNNN | | PAARWESPDR | | GWEREQPAAS | | TAAASLFECS |
RIKALADERE | | AVQKKTFTKW | | VNSHLARVGC | | HIGDLYVDLR | | DGFVLTRLLE |
VLSGEQLPRP | | TRGRMRIHSL | | ENVDKALQFL | | KEQRVHLENV | | GSHDIVDGNH |
RLTLGLVWTI | | ILRFQIQVIK | | IETEDNRETR | | SAKDALLLWC | | QMKTAGYPEV |
NIQNFTTSWR | | DGLAFNALIH | | RHRPDLVDFS | | KLTKSNANYN | | LQRAFRTAEQ |
HLGLARLLDP | | EDVNMEAPDE | | KSIITYVVSF | | YHYFSKMKAL | | AVEGKRIGKV |
LDQVLEVGKI | | IERYEELAAE | | LLAWIHRTVG | | LISNQKFANS | | LSGVQQQLQA |
FTAYCTLEKP | | VKFQEKGNLE | | VLLFSIQSKL | | RACNRRLFVP | | REGCGIWDID |
KAWGELEKAE | | HEREAALRAE | | LIRQEKLELL | | AQRFDHKVAM | | RESWLNENQR |
LVSQDNFGYE | | LPAVEAAMKK | | HEAIEADIAA | | YEERVQGVAE | | LAQALAAEGY |
YDIRRVAAQR | | DSVLRQWALL | | TGLVGARRTR | | LEQNLALQKV | | FQEMVYMVDW |
MEEMQAQLLS | | RECGQHLVEA | | DDLLQKHGLL | | EGDIAAQSER | | VEALNAAALR |
FSQLQGYQPC | | DPQVICNRVN | | HVHGCLAELQ | | EQAARRRAEL | | EASRSLWALL |
QELEEAESWA | | RDKERLLEAA | | GGGGAAGAAG | | AAGTAGGAHD | | LSSTARLLAQ |
HKILQGELGG | | RRALLQQALR | | CGEELVAAGG | | AVGPGADTVH | | LVGLAERAAS |
ARRRWQRLEE | | AAARRERRLQ | | EARALHQFGA | | DLDGLLDWLR | | DAYRLAAAGD |
FGHDEASSRR | | LARQHRALTG | | EVEAHRGPVS | | GLRRQLATLG | | GASGAGPLVV |
ALQVRVVEAE | | QLFAEVTEVA | | ALRRQWLRDA | | LAVYRMFGEV | | HACELWIGEK |
EQWLLSMRVP | | DSLDDVEVVQ | | HRFESLDQEM | | NSLMGRVLDV | | NHTVQELVEG |
GHPSSDEVRS | | CQDHLNSRWN | | RIVELVEQRK | | EEMSAVLLVE | | NHVLEVAEVR |
AQVREKRRAV | | ESAPRAGGAL | | QWRLSGLEAA | | LQALEPRQAA | | LLEEAALLAE |
RFPAQAARLH | | QGAEELGAEW | | GALASAAQAC | | GEAVAAAGRL | | QRFLHDLDAF |
LDWLVRAQEA | | AGGSEGPLPN | | SLEEADALLA | | RHAALKEEVD | | QREEDYARIV |
AASEALLAAD | | GAELGPGLAL | | DEWLPHLELG | | WHKLLGLWEA | | RREALVQAHI |
YQLFLRDLRQ | | ALVVLRNQEM | | ALSGAELPGT | | VESVEEALKQ | | HRDFLTTMEL |
SQQKMQVAVQ | | AAEGLLRQGN | | IYGEQAQEAV | | TRLLEKNQEN | | QLRAQQWMQK |
LHDQLELQHF | | LRDCHELDGW | | IHEKMLMARD | | GTREDNHKLH | | KRWLRHQAFM |
AELAQNKEWL | | EKIEREGQQL | | MQEKPELAAS | | VRKKLGEIRQ | | CWAELESTTQ |
AKARQLFEAS | | KADQLVQSFA | | ELDKKLLHME | | SQLQDVDPGG | | DLATVNSQLK |
KLQSMESQVE | | EWYREVGELQ | | AQTAALPLEP | | ASKELVGERQ | | NAVGERLVRL |
LEPLQERRRL | | LLASKELHQV | | AHDLDDELAW | | VQERLPLAMQ | | TERGNGLQAV |
QQHIKKNQGL | | RREIQAHGPR | | LEEVLERAGA | | LASLRSPEAE | | AVRRGLEQLQ |
SAWAGLREAA | | ERRQQVLDAA | | FQVEQYYFDV | | AEVEAWLGEQ | | ELLMMSEDKG |
KDEQSTLQLL | | KKHLQLEQGV | | ENYEESIAQL | | SRQCRALLEM | | GHPDSEQISR |
RQSQVDRLYV | | ALKELGEERR | | VALEQQYWLY | | QLSRQVSELE | | HWIAEKEVVA |
GSPELGQDFE | | HVSVLQEKFS | | EFASETGMAG | | RERLAAVNQM | | VDELIECGHT |
AAATMAEWKD | | GLNEAWAELL | | ELMGTRAQLL | | AASRELHKFF | | SDARELQGQI |
EEKRRRLPRL | | TTPPEPRPSA | | SSMQRTLRAF | | EHDLQLLVSQ | | VRQLQEGAAQ |
LRTVYAGEHA | | EAIASREQEV | | LQGWKELLSA | | CEDARLHVSS | | TADALRFHSQ |
VRDLLSWMDG | | IASQIGAADK | | PRDVSSVEVL | | MNYHQGLKTE | | LEARVPELTT |
CQELGRSLLL | | NKSAMADEIQ | | AQLDKLGTRK | | EEVSEKWDRH | | WEWLQQMLEV |
HQFAQEAVVA | | DAWLTAQEPL | | LQSRELGSSV | | DEVEQLIRRH | | EAFRKAAAAW |
EERFSSLRRL | | TTIEKIKAEQ | | SKQPPTPLLG | | RKFFGDPTEL | | AAKAAPLLRP |
GGYERGLEPL | | ARRASDTLSA | | EVRTRVGYVR | | QELKPERLQP | | RIDRLPEIPG |
RVEPAALPAA | | PEDAAETPAT | | PAAAEQVRPR | | PERQESADRA | | EELPRRRRPE |
RQESVDQSEE | | AARRRRPERQ | | ESAEHEAAHS | | LTLGRYEQME | | RRRERRERRL |
ERQESSEQEM | | PIRGDLVKGK | | ATLADIVEQL | | QEKEAGPGLP | | AGPSLPQPRE |
LPPGRLPNGL | | ELPERTPRPD | | RPRARDRPKP | | RRRPRPREGG | | EGGGSRRSRS |
APAQGGSAPA | | PPPPPTHTVQ | | HEGFLLRKRE | | LDANRKSSNR | | SWVSLYCVLS |
KGELGFYKDS | | KGPASGSTHG | | GEPLLSLHKA | | TSEVASDYKK | | KKHVFKLQTQ |
DGSEFLLQAK | | DEEEMNGWLE | | AVASSVAEHA | | EIARWGQTLP | | TTSSTDEGNP |
KREGGDRRAS | | GRRK |
Кодований геном білок за функцією належить до кепінгів актину. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.
Література
- Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14896 (англ.) . Архів оригіналу за 6 квітня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9H254 (англ.) . Архів оригіналу за 20 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Людські | Мікрофіламенти та актин-зв'язуючі білки | Міофіламенти | Актин | |
---|
Міозин | - I
- II
- III
- V
- VI
- VII
- IX
- X
- XV
- XVIII
- Легкий ланцюг міозину
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Проміжні філаменти | Тип 1/2 (Кератин, Цитокератин) | Епітеліальні кератини (м'які альфа-кератини) | - тип I/хромосома 17
- хромосома 12
- інші
|
---|
Кератини волосся (жорсткі альфа-кератини) | |
---|
Незгруповані альфа | |
---|
Не-альфа | |
---|
|
---|
Тип 3 | |
---|
Тип 4 | - Інтернексин
- Нестин
- Нейрофіламент
- Синемін
- Синкоїлін
|
---|
Тип 5 | |
---|
|
---|
Мікротрубочки та пов'язані білки | |
---|
Катеніни | |
---|
Мембранні | |
---|
Інші | |
---|
|
---|
Нелюдські | |
---|