MYO6 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2N11, 2N13, 2N0Z, 2N10, 2N12 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | MYO6, DFNA22, DFNB37, myosin VI, Myo6-008, Myo6-007 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 600970 MGI: 104785 HomoloGene: 56417 GeneCards: MYO6 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
autosomal recessive nonsyndromic deafness 37, nonsyndromic deafness, autosomal dominant nonsyndromic deafness 22[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • cytoskeletal motor activity • actin filament binding • ATP binding • calmodulin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • minus-end directed microfilament motor activity • ADP binding • actin binding • nucleotide binding • cadherin binding • identical protein binding |
---|
Клітинна компонента | • myosin complex • клітинне ядро • внутрішньоклітинна мембранна органела • cell projection • ruffle membrane • RNA polymerase II, holoenzyme • нуклеоплазма • lysosomal membrane • perinuclear region of cytoplasm • clathrin-coated endocytic vesicle • apical part of cell • clathrin-coated vesicle membrane • ruffle • гіалоплазма • екзосома • мембрана • clathrin-coated pit • filamentous actin • клітинна мембрана • ядерна мембрана • цитоплазма • cell cortex • Мікроворсинки • комплекс Ґольджі • unconventional myosin complex • endocytic vesicle • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • мікрофіламент • GO:0009327 protein-containing complex • clathrin-coated vesicle • Філоподія |
---|
Біологічний процес | • intracellular protein transport • actin filament-based movement • regulation of secretion • слух • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • protein transport • ендоцитоз • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator • GO:0015915 транспорт |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001300899 NM_004999 NM_001368136 NM_001368137 NM_001368138
| NM_001368139 NM_001368140 NM_001368865 NM_001368866 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_001287828 NP_004990 NP_001355065 NP_001355066 NP_001355067
| NP_001355068 NP_001355069 NP_001355794 NP_001355795 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 75.75 – 75.92 Mb | Хр. 9: 80.07 – 80.22 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
MYO6 (англ. Myosin VI) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 294 амінокислот, а молекулярна маса — 149 691[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEDGKPVWAP | | HPTDGFQMGN | | IVDIGPDSLT | | IEPLNQKGKT | | FLALINQVFP |
AEEDSKKDVE | | DNCSLMYLNE | | ATLLHNIKVR | | YSKDRIYTYV | | ANILIAVNPY |
FDIPKIYSSE | | AIKSYQGKSL | | GTRPPHVFAI | | ADKAFRDMKV | | LKMSQSIIVS |
GESGAGKTEN | | TKFVLRYLTE | | SYGTGQDIDD | | RIVEANPLLE | | AFGNAKTVRN |
NNSSRFGKFV | | EIHFNEKSSV | | VGGFVSHYLL | | EKSRICVQGK | | EERNYHIFYR |
LCAGASEDIR | | EKLHLSSPDN | | FRYLNRGCTR | | YFANKETDKQ | | ILQNRKSPEY |
LKAGSMKDPL | | LDDHGDFIRM | | CTAMKKIGLD | | DEEKLDLFRV | | VAGVLHLGNI |
DFEEAGSTSG | | GCNLKNKSAQ | | SLEYCAELLG | | LDQDDLRVSL | | TTRVMLTTAG |
GTKGTVIKVP | | LKVEQANNAR | | DALAKTVYSH | | LFDHVVNRVN | | QCFPFETSSY |
FIGVLDIAGF | | EYFEHNSFEQ | | FCINYCNEKL | | QQFFNERILK | | EEQELYQKEG |
LGVNEVHYVD | | NQDCIDLIEA | | KLVGILDILD | | EENRLPQPSD | | QHFTSAVHQK |
HKDHFRLTIP | | RKSKLAVHRN | | IRDDEGFIIR | | HFAGAVCYET | | TQFVEKNNDA |
LHMSLESLIC | | ESRDKFIREL | | FESSTNNNKD | | TKQKAGKLSF | | ISVGNKFKTQ |
LNLLLDKLRS | | TGASFIRCIK | | PNLKMTSHHF | | EGAQILSQLQ | | CSGMVSVLDL |
MQGGYPSRAS | | FHELYNMYKK | | YMPDKLARLD | | PRLFCKALFK | | ALGLNENDYK |
FGLTKVFFRP | | GKFAEFDQIM | | KSDPDHLAEL | | VKRVNHWLTC | | SRWKKVQWCS |
LSVIKLKNKI | | KYRAEACIKM | | QKTIRMWLCK | | RRHKPRIDGL | | VKVGTLKKRL |
DKFNEVVSVL | | KDGKPEMNKQ | | IKNLEISIDT | | LMAKIKSTMM | | TQEQIQKEYD |
ALVKSSEELL | | SALQKKKQQE | | EEAERLRRIQ | | EEMEKERKRR | | EEDEKRRRKE |
EEERRMKLEM | | EAKRKQEEEE | | RKKREDDEKR | | IQAEVEAQLA | | RQKEEESQQQ |
AVLEQERRDR | | ELALRIAQSE | | AELISDEAQA | | DLALRRSLDS | | YPVSKNDGTR |
PKMTPEQMAK | | EMSEFLSRGP | | AVLATKAAAG | | TKKYDLSKWK | | YAELRDTINT |
SCDIELLAAC | | REEFHRRLKV | | YHAWKSKNKK | | RNTETEQRAP | | KSVTDYDFAP |
FLNNSPQQNP | | AAQIPARQRE | | IEMNRQQRFF | | RIPFIRPADQ | | YKDPQSKKKG |
WWYAHFDGPW | | IARQMELHPD | | KPPILLVAGK | | DDMEMCELNL | | EETGLTRKRG |
AEILPRQFEE | | IWERCGGIQY | | LQNAIESRQA | | RPTYATAMLQ | | SLLK |
Кодований геном білок за функціями належить до білкових моторів, міозинів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ендоцитоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, молекулою актину, молекулою кальмодуліну. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, клатрин-вкритих заглибинах мембрани, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Buss F., Arden S.D., Lindsay M., Luzio J.P., Kendrick-Jones J. (2001). Myosin VI isoform localized to clathrin-coated vesicles with a role in clathrin-mediated endocytosis. EMBO J. 20: 3676—3684. PMID 11447109 DOI:10.1093/emboj/20.14.3676
- Jung E.J., Liu G., Zhou W., Chen X. (2006). Myosin VI is a mediator of the p53-dependent cell survival pathway. Mol. Cell. Biol. 26: 2175—2186. PMID 16507995 DOI:10.1128/MCB.26.6.2175-2186.2006
- Spink B.J., Sivaramakrishnan S., Lipfert J., Doniach S., Spudich J.A. (2008). Long single alpha-helical tail domains bridge the gap between structure and function of myosin VI. Nat. Struct. Mol. Biol. 15: 591—597. PMID 18511944 DOI:10.1038/nsmb.1429
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з MYO6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7605 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q9UM54 (англ.) . Архів оригіналу за 6 грудня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Людські | Мікрофіламенти та актин-зв'язуючі білки | Міофіламенти | Актин | |
---|
Міозин | - I
- II
- III
- V
- VI
- VII
- IX
- X
- XV
- XVIII
- Легкий ланцюг міозину
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Проміжні філаменти | Тип 1/2 (Кератин, Цитокератин) | Епітеліальні кератини (м'які альфа-кератини) | - тип I/хромосома 17
- хромосома 12
- інші
|
---|
Кератини волосся (жорсткі альфа-кератини) | |
---|
Незгруповані альфа | |
---|
Не-альфа | |
---|
|
---|
Тип 3 | |
---|
Тип 4 | - Інтернексин
- Нестин
- Нейрофіламент
- Синемін
- Синкоїлін
|
---|
Тип 5 | |
---|
|
---|
Мікротрубочки та пов'язані білки | |
---|
Катеніни | |
---|
Мембранні | |
---|
Інші | |
---|
|
---|
Нелюдські | |
---|