TRPC6 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | TRPC6, FSGS2, TRP6, transient receptor potential cation channel subfamily C member 6 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603652 MGI: 109523 HomoloGene: 37944 GeneCards: TRPC6 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
focal segmental glomerulosclerosis 2, focal segmental glomerulosclerosis, familial idiopathic steroid-resistant nephrotic syndrome[1] |
|
Реагує на сполуку |
---|
20-HETE, Арахідонова кислота, 2-aminoethoxydiphenylborate, гідрон[2] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • actinin binding • store-operated calcium channel activity • clathrin binding • inositol 1,4,5 trisphosphate binding • ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • actin binding • calcium channel activity • cation channel activity • protein homodimerization activity • ATPase binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • slit diaphragm • cation channel complex |
---|
Біологічний процес | • regulation of cytosolic calcium ion concentration • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration • GO:0010260 старіння людини • cation transport • ion transport • single fertilization • platelet activation • positive regulation of ion transmembrane transporter activity • negative regulation of dendrite morphogenesis • positive regulation of peptidyl-threonine phosphorylation • calcium ion transmembrane transport • positive regulation of neuron differentiation • neuron differentiation • manganese ion transport • cellular response to hypoxia • calcium ion transport • cellular response to hydrogen peroxide • positive regulation of calcium ion transport • трансмембранний транспорт |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_001282086 NM_001282087 NM_013838 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_001269015 NP_001269016 NP_038866 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 101.45 – 101.87 Mb | Хр. 9: 8.54 – 8.68 Mb |
---|
PubMed search | [3] | [4] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TRPC6 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily C member 6) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 931 амінокислот, а молекулярна маса — 106 326[6].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSQSPAFGPR | | RGSSPRGAAG | | AAARRNESQD | | YLLMDSELGE | | DGCPQAPLPC |
YGYYPCFRGS | | DNRLAHRRQT | | VLREKGRRLA | | NRGPAYMFSD | | RSTSLSIEEE |
RFLDAAEYGN | | IPVVRKMLEE | | CHSLNVNCVD | | YMGQNALQLA | | VANEHLEITE |
LLLKKENLSR | | VGDALLLAIS | | KGYVRIVEAI | | LSHPAFAEGK | | RLATSPSQSE |
LQQDDFYAYD | | EDGTRFSHDV | | TPIILAAHCQ | | EYEIVHTLLR | | KGARIERPHD |
YFCKCNDCNQ | | KQKHDSFSHS | | RSRINAYKGL | | ASPAYLSLSS | | EDPVMTALEL |
SNELAVLANI | | EKEFKNDYKK | | LSMQCKDFVV | | GLLDLCRNTE | | EVEAILNGDV |
ETLQSGDHGR | | PNLSRLKLAI | | KYEVKKFVAH | | PNCQQQLLSI | | WYENLSGLRQ |
QTMAVKFLVV | | LAVAIGLPFL | | ALIYWFAPCS | | KMGKIMRGPF | | MKFVAHAASF |
TIFLGLLVMN | | AADRFEGTKL | | LPNETSTDNA | | KQLFRMKTSC | | FSWMEMLIIS |
WVIGMIWAEC | | KEIWTQGPKE | | YLFELWNMLD | | FGMLAIFAAS | | FIARFMAFWH |
ASKAQSIIDA | | NDTLKDLTKV | | TLGDNVKYYN | | LARIKWDPSD | | PQIISEGLYA |
IAVVLSFSRI | | AYILPANESF | | GPLQISLGRT | | VKDIFKFMVI | | FIMVFVAFMI |
GMFNLYSYYI | | GAKQNEAFTT | | VEESFKTLFW | | AIFGLSEVKS | | VVINYNHKFI |
ENIGYVLYGV | | YNVTMVIVLL | | NMLIAMINSS | | FQEIEDDADV | | EWKFARAKLW |
FSYFEEGRTL | | PVPFNLVPSP | | KSLFYLLLKL | | KKWISELFQG | | HKKGFQEDAE |
MNKINEEKKL | | GILGSHEDLS | | KLSLDKKQVG | | HNKQPSIRSS | | EDFHLNSFNN |
PPRQYQKIMK | | RLIKRYVLQA | | QIDKESDEVN | | EGELKEIKQD | | ISSLRYELLE |
EKSQNTEDLA | | ELIRELGEKL | | SMEPNQEETN | | R |
Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у мембрані.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Lussier M. P., Lepage P. K., Bousquet S. M., Boulay G. (2008). RNF24, a new TRPC interacting protein, causes the intracellular retention of TRPC. Cell Calcium. 43: 432—443. PMID 17850865 DOI:10.1016/j.ceca.2007.07.009
Див. також
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з TRPC6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Transient receptor potential cation channel subfamily C member 6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12338 (англ.) . Архів оригіналу за 15 травня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9Y210 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Ліганд-залежні | |
---|
Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
|
|
---|
постійно відчинені | |
---|
Протончутливі | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
K+: Калієві канали |
---|
Кальцій-активовані | |
---|
Вхідного випрямлення | |
---|
Двопородоменні | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
|
|