OPN1SW |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | OPN1SW, BCP, BOP, CBT, opsin 1 (cone pigments), short-wave-sensitive, opsin 1, short wave sensitive |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 613522 MGI: 99438 HomoloGene: 1291 GeneCards: OPN1SW |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
тританопія[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • G protein-coupled receptor activity • photoreceptor activity • signal transducer activity • G protein-coupled photoreceptor activity • signaling receptor activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • integral component of plasma membrane • мембрана • photoreceptor outer segment • photoreceptor disc membrane |
---|
Біологічний процес | • відповідь на стимул • GO:0072468 сигнальна трансдукція • зір • retinoid metabolic process • phototransduction • detection of visible light • G protein-coupled receptor signaling pathway • cellular response to light stimulus |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 7: 128.77 – 128.78 Mb | Хр. 6: 29.38 – 29.39 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
OPN1SW (англ. Opsin 1, short wave sensitive) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 348 амінокислот, а молекулярна маса — 39 135[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MRKMSEEEFY | | LFKNISSVGP | | WDGPQYHIAP | | VWAFYLQAAF | | MGTVFLIGFP |
LNAMVLVATL | | RYKKLRQPLN | | YILVNVSFGG | | FLLCIFSVFP | | VFVASCNGYF |
VFGRHVCALE | | GFLGTVAGLV | | TGWSLAFLAF | | ERYIVICKPF | | GNFRFSSKHA |
LTVVLATWTI | | GIGVSIPPFF | | GWSRFIPEGL | | QCSCGPDWYT | | VGTKYRSESY |
TWFLFIFCFI | | VPLSLICFSY | | TQLLRALKAV | | AAQQQESATT | | QKAEREVSRM |
VVVMVGSFCV | | CYVPYAAFAM | | YMVNNRNHGL | | DLRLVTIPSF | | FSKSACIYNP |
IIYCFMNKQF | | QACIMKMVCG | | KAMTDESDTC | | SSQKTEVSTV | | SSTQVGPN |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з хромофором. Локалізований у мембрані.
Література
- Nathans J., Thomas D., Hogness D.S. (1986). Molecular genetics of human color vision: the genes encoding blue, green, and red pigments. Science. 232: 193—202. PMID 2937147 DOI:10.1126/science.2937147
- Shimmin L.C., Mai P., Li W.H. (1997). Sequences and evolution of human and squirrel monkey blue opsin genes. J. Mol. Evol. 44: 378—382. PMID 9089077 DOI:10.1007/PL00006157
- Sarkar G., Sommer S.S. (1989). Access to a messenger RNA sequence or its protein product is not limited by tissue or species specificity. Science. 244: 331—334. PMID 2565599 DOI:10.1126/science.2565599
- Applebury M.L., Hargrave P.A. (1986). Molecular biology of the visual pigments. Vision Res. 26: 1881—1895. PMID 3303660 DOI:10.1016/0042-6989(86)90115-X
- Weitz C.J., Went L.N., Nathans J. (1992). Human tritanopia associated with a third amino acid substitution in the blue-sensitive visual pigment. Am. J. Hum. Genet. 51: 444—446. PMID 1386496
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з OPN1SW переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1012 (англ.) . Архів оригіналу за 1 квітня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P03999 (англ.) . Архів оригіналу за 7 травня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Рецептори нейромедіаторів | Адренорецептори | |
---|
Пуринові рецептори | - Аденозинові рецептори
- P2Y
|
---|
Серотонінові рецептори | - (крім 5-HT3) 5-HT1
- 5-HT2
- 5-HT
- 5A
- 6
- 7)
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Метаболіти та сигнальні молекули | Ейкозаноїдні рецептори | |
---|
Інші | |
---|
|
---|
Пептиди | Рецептори нейропептидів | - B/W
- FF
- S
- Y
- Нейромедин
- Нейротенсин
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Різні | |
---|
|
|
|
|
|