CXCL12

Chemokine (C-X-C motif) ligand 12
PDB rendering based on 1a15.
有效结构
PDB 直系同源检索:PDBe, RCSB
PDB查询代码列表

1A15, 1QG7, 1SDF, 1VMC, 2J7Z, 2K01, 2K03, 2K04, 2K05, 2KEC, 2KED, 2KEE, 2KOL, 2NWG, 2SDF, 3GV3, 3HP3

标识
代号 CXCL12; IRH; PBSF; SCYB12; SDF1; SDF1A; SDF1B; TLSF; TPAR1
扩展标识 遗传学:600835 鼠基因:103556 同源基因:128606 GeneCards: CXCL12 Gene
基因本体论描述
分子功能 · receptor binding

· chemokine activity
· growth factor activity

· CXCR chemokine receptor binding
细胞成分 · extracellular region

· extracellular space

· external side of plasma membrane
生物过程 · patterning of blood vessels

· ameboidal cell migration
· cellular calcium ion homeostasis
· chemotaxis
· immune response
· cell adhesion
· signal transduction
· G-protein coupled receptor signaling pathway
· germ cell development
· brain development
· blood circulation
· motor neuron axon guidance
· regulation of actin polymerization or depolymerization
· germ cell migration
· response to virus
· T cell proliferation
· negative regulation of apoptotic process
· induction of positive chemotaxis
· chemokine-mediated signaling pathway
· positive regulation of monocyte chemotaxis

· negative regulation of leukocyte apoptotic process
Sources: Amigo / QuickGO
RNA表达模式
更多表达数据
直系同源体
物种 人类 小鼠
Entrez 6387 20315
Ensembl ENSG00000107562 ENSMUSG00000061353
UniProt P48061 P40224
mRNA序列 NM_000609 NM_001012477.2
蛋白序列 NP_000600 NP_001012495.1
基因位置 Chr 10:
44.79 – 44.88 Mb
Chr 6:
117.12 – 117.13 Mb
PubMed查询 [1] [2]

趋化因子CXCL12 又称基质细胞衍生因子-1(SDF-1)是小分子的细胞因子,属于趋化因子蛋白家族。它有两种形式,SDF-1α/CXCL12a和SDF-1β/CXCL12b[1]。趋化因子有四个保守的半胱氨酸残基形成两对双硫键以构成趋化因子的特殊结构。第一第二半胱氨酸残基之间隔着一个介入氨基酸残基。

趋化因子CXCL12对淋巴细胞有强烈的趋化作用并在发育中起重要作用[2]。在胚胎發育中CXCL12引导造血干细胞从胎儿肝脏骨髓的迁徙。CXCL12基因敲除的小鼠往往在胎中或出生后1小时内死亡[3][4]。SDF-1α/CXCL12a还可以影响神经元的电生理。CXCL12可以在许多组织(包括胸腺,心,,骨髓,脾脏)中表达。

趋化因子CXCL12的受体是CXCR4[5]。但是,最近有人认为CXCL12还可以与CXCR7受体结合[6]

参考文献

  1. ^ De La Luz Sierra et al. Differential processing of stromal-derived factor-1alpha and beta explains functional diversity. Blood 103:2452-2459, 2004.
  2. ^ Bleul et al. A highly efficacious lymphocyte chemoattractant, stromal cell-derived factor 1 (SDF-1). J. Exp. Med. 184: 1101-1109, 1996.
  3. ^ Ara et al. Impaired colonization of the gonads by primordial germ cells in mice lacking a chemokine, stromal cell-derived factor-1 (SDF-1). Proc. Nat. Acad. Sci. 100: 5319-5323, 2003.
  4. ^ Ma et al. Impaired B-lymphopoiesis, myelopoiesis, and derailed cerebellar neuron migration in CXCR4- and SDF-1-deficient mice. Proc. Nat. Acad. Sci. 95: 9448-9453, 1998.
  5. ^ Bleul et al. The lymphocyte chemoattractant SDF-1 is a ligand for LESTR/fusin and blocks HIV-1 entry. Nature 382: 829-833, 1996.
  6. ^ Balabanian et al. The chemokine SDF-1/CXCl12 binds to and signals through the orphan receptor RDC1 in T lymphocytes. J Biol Chem 280:35760-35766, 2005.
按族分类
趋化因子
CCL
  • CCL1
  • CCL2英语CCL2/MCP-1
  • CCL3英语CCL3/MIP-1α
  • CCL4英语CCL4/MIP-1β
  • CCL5英语CCL5/RANTES
  • CCL6英语CCL6
  • CCL7英语CCL7
  • CCL8英语CCL8
  • CCL9
  • CCL11英语CCL11
  • CCL12
  • CCL13英语CCL13
  • CCL14英语CCL14
  • CCL15英语CCL15
  • CCL16英语CCL16
  • CCL17英语CCL17
  • CCL18英语CCL18
  • CCL19英语CCL19
  • CCL20英语CCL20
  • CCL21英语CCL21
  • CCL22英语CCL22
  • CCL23英语CCL23
  • CCL24英语CCL24
  • CCL25英语CCL25
  • CCL26英语CCL26
  • CCL27英语CCL27
  • CCL28英语CCL28
CXCL
  • CXCL1/KC
  • CXCL2英语CXCL2
  • CXCL3英语CXCL3
  • CXCL4/PF4
  • CXCL5英语CXCL5
  • CXCL6英语CXCL6
  • CXCL7/β-tg
  • CXCL8/IL8
  • CXCL9
  • CXCL10
  • CXCL11
  • CXCL12/SDF-1
  • CXCL13英语CXCL13
  • CXCL14英语CXCL14
  • CXCL15英语CXCL15
  • CXCL16英语CXCL16
  • CXCL17英语CXCL17
CX3CL
  • CX3CL1英语CX3CL1
XCL
  • XCL1英语XCL1
  • XCL2英语XCL2
肿瘤坏死因子
(TNF)超家族
英语Tumor necrosis factor superfamily

  • 肿瘤坏死因子
  • 淋巴毒素
    • TNFB/LTA英语Lymphotoxin alpha
    • TNFC/LTB英语Lymphotoxin beta
  • TNFSF4英语OX40L
  • TNFSF5/CD40LG英语CD154
  • TNFSF6英语Fas ligand
  • TNFSF7英语CD70
  • TNFSF8英语CD153
  • TNFSF9英语4-1BB ligand
  • TNFSF10英语TRAIL
  • TNFSF11
  • TNFSF13英语APRIL (protein)
  • TNFSF13B英语B-cell activating factor
  • EDA
白细胞介素
(IL)
受体为
I型细胞因子受体
受体共用β链
  • IL2/IL15
  • IL4/IL13
  • IL7
  • IL9
  • IL21
受体共用γ链
IL-6家族/CD130英语Glycoprotein 130
  • IL6
  • IL11英语Interleukin 11
  • IL27
  • IL30英语Interleukin 30
  • IL31英语Interleukin 31
    • +不属于白介素的 OSM
    • LIF
    • CNTF英语Ciliary neurotrophic factor
    • CT-1英语Cardiotrophin 1
IL-12家族/IL12RB1英语Interleukin 12 receptor, beta 1 subunit
  • IL12英语Interleukin 12
  • IL23英语Interleukin 23
  • IL27英语Interleukin-27
  • IL35英语Interleukin 35
其它
  • IL14英语Interleukin 14
  • IL16英语Interleukin 16
  • IL32英语Interleukin 32
  • IL34英语Interleukin 34
受体为
II型细胞因子受体
IL-10家族
  • IL10/IL22英语Interleukin 22
  • IL19英语Interleukin 19
  • IL20英语Interleukin 20
  • IL24英语Interleukin 24
  • IL26英语Interleukin 26
  • III型干扰素
    • IL28英语Interleukin 28
    • IL29英语Interleukin 29
干扰素
(IFN)
I型
  • Interferon, alpha 1英语Interferon, alpha 1
  • IFNA2英语IFNA2
  • IFNA4英语IFNA4
  • IFNA5英语IFNA5
  • IFNA6英语IFNA6
  • IFNA7英语IFNA7
  • IFNA8英语IFNA8
  • IFNA10英语IFNA10
  • IFNA13英语IFNA13
  • IFNA14英语IFNA14
  • IFNA16英语IFNA16
  • IFNA17英语IFNA17
  • IFNA21英语IFNA21
  • IFNB1英语IFNB1
  • IFNK英语IFNK
  • IFNW1英语IFNW1
II型
免疫球蛋白超家族英语Immunoglobulin superfamily
  • IL-1家族IL1A英语IL1A
  • IL1B英语IL1B
  • Interleukin 1 receptor antagonist英语Interleukin 1 receptor antagonist
  • IL1F5英语IL1F5
  • IL1F6英语IL1F6
  • IL1F7英语IL1F7
  • IL1F8英语IL1F8
  • IL1F9英语IL1F9
  • IL1F10英语IL1F10
  • Interleukin 33英语Interleukin 33
  • Interleukin 18英语Interleukin 18
IL-17家族英语IL-17 family
  • IL17A英语IL17A
  • IL17B烏克蘭語IL17B
  • IL17C烏克蘭語IL17C
  • IL17D烏克蘭語IL17D
  • IL17E/IL-25英语Interleukin 25
  • IL17F烏克蘭語IL17F
其它
  • 骨桥蛋白
  • 巨噬细胞迁移抑制因子英语Macrophage migration inhibitory factor
按临床
功能分类
 
信号转导索引
描述
  • 胞外
    • 神經肽
    • 生长因子
    • 细胞因子
    • 激素
  • 細胞表面受體英语Template:Cell surface receptors
    • 配体门控离子通道
    • 酶联受體
    • G蛋白偶聯受體
    • 免疫球蛋白超家族英语Template:Immunoglobulin superfamily immune receptors
    • 整合素
    • 神經肽受體
    • 生長因子受體
    • 细胞因子受體
  • 胞內
    • 受體蛋白英语Template:Signal transducing adaptor proteins
    • GTP-binding英语Template:GTP-binding protein regulators
    • MAP激酶
  • 鈣信號
  • 脂質系號
  • 路徑
    • hedgehog
    • Wnt
    • TGF-β
    • MAPK ERK英语Template:MAPK ERK signaling pathway
    • notch英语Template:Notch signaling pathway
    • JAK-STAT
    • 細胞凋亡
    • hippo英语Template:Hippo signaling pathway
    • TLR