WDFY3 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | WDFY3, ALFY, ZFYVE25, WD repeat and FYVE domain containing 3, BCHS, MCPH18 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 617485 MGI: 1096875 HomoloGene: 22855 GeneCards: WDFY3 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
syndromic intellectual disability[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • 1-phosphatidylinositol binding • beta-N-acetylglucosaminylglycopeptide beta-1,4-galactosyltransferase activity • зв'язування з іоном металу • lipid binding |
---|
Клітинна компонента | • Atg12-Atg5-Atg16 complex • PML body • ядерна мембрана • nuclear envelope • extrinsic component of membrane • extrinsic component of autophagosome membrane • autophagosome • цитоплазма • inclusion body • мембрана • клітинне ядро • ядерце • клітинна мембрана • гіалоплазма • аксон • cell projection • перикаріон |
---|
Біологічний процес | • aggrephagy • автофагія • multicellular organism development |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_014991 NM_178583 NM_178585 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 4: 84.67 – 84.97 Mb | Хр. 5: 101.98 – 102.22 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
WDFY3 (англ. WD repeat and FYVE domain containing 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 526 амінокислот, а молекулярна маса — 395 258[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MNMVKRIMGR | | PRQEECSPQD | | NALGLMHLRR | | LFTELCHPPR | | HMTQKEQEEK |
LYMMLPVFNR | | VFGNAPPNTM | | TEKFSDLLQF | | TTQVSRLMVT | | EIRRRASNKS |
TEAASRAIVQ | | FLEINQSEEA | | SRGWMLLTTI | | NLLASSGQKT | | VDCMTTMSVP |
STLVKCLYLF | | FDLPHVPEAV | | GGAQNELPLA | | ERRGLLQKVF | | VQILVKLCSF |
VSPAEELAQK | | DDLQLLFSAI | | TSWCPPYNLP | | WRKSAGEVLM | | TISRHGLSVN |
VVKYIHEKEC | | LSTCVQNMQQ | | SDDLSPLEIV | | EMFAGLSCFL | | KDSSDVSQTL |
LDDFRIWQGY | | NFLCDLLLRL | | EQAKEAESKD | | ALKDLVNLIT | | SLTTYGVSEL |
KPAGITTGAP | | FLLPGFAVPQ | | PAGKGHSVRN | | VQAFAVLQNA | | FLKAKTSFLA |
QIILDAITNI | | YMADNANYFI | | LESQHTLSQF | | AEKISKLPEV | | QNKYFEMLEF |
VVFSLNYIPC | | KELISVSILL | | KSSSSYHCSI | | IAMKTLLKFT | | RHDYIFKDVF |
REVGLLEVMV | | NLLHKYAALL | | KDPTQALNEQ | | GDSRNNSSVE | | DQKHLALLVM |
ETLTVLLQGS | | NTNAGIFREF | | GGARCAHNIV | | KYPQCRQHAL | | MTIQQLVLSP |
NGDDDMGTLL | | GLMHSAPPTE | | LQLKTDILRA | | LLSVLRESHR | | SRTVFRKVGG |
FVYITSLLVA | | MERSLSCPPK | | NGWEKVNQNQ | | VFELLHTVFC | | TLTAAMRYEP |
ANSHFFKTEI | | QYEKLADAVR | | FLGCFSDLRK | | ISAMNVFPSN | | TQPFQRLLEE |
DVISIESVSP | | TLRHCSKLFI | | YLYKVATDSF | | DSRAEQIPPC | | LTSESSLPSP |
WGTPALSRKR | | HAYHSVSTPP | | VYPPKNVADL | | KLHVTTSSLQ | | SSDAVIIHPG |
AMLAMLDLLA | | SVGSVTQPEH | | ALDLQLAVAN | | ILQSLVHTER | | NQQVMCEAGL |
HARLLQRCSA | | ALADEDHSLH | | PPLQRMFERL | | ASQALEPMVL | | REFLRLASPL |
NCGAWDKKLL | | KQYRVHKPSS | | LSYEPEMRSS | | MITSLEGLGT | | DNVFSLHEDN |
HYRISKSLVK | | SAEGSTVPLT | | RVKCLVSMTT | | PHDIRLHGSS | | VTPAFVEFDT |
SLEGFGCLFL | | PSLAPHNAPT | | NNTVTTGLID | | GAVVSGIGSG | | ERFFPPPSGL |
SYSSWFCIEH | | FSSPPNNHPV | | RLLTVVRRAN | | SSEQHYVCLA | | IVLSAKDRSL |
IVSTKEELLQ | | NYVDDFSEES | | SFYEILPCCA | | RFRCGELIIE | | GQWHHLVLVM |
SKGMLKNSTA | | ALYIDGQLVN | | TVKLHYVHST | | PGGSGSANPP | | VVSTVYAYIG |
TPPAQRQIAS | | LVWRLGPTHF | | LEEVLPSSNV | | TTIYELGPNY | | VGSFQAVCMP |
CKDAKSEGVV | | PSPVSLVPEE | | KVSFGLYALS | | VSSLTVARIR | | KVYNKLDSKA |
IAKQLGISSH | | ENATPVKLIH | | NSAGHLNGSA | | RTIGAALIGY | | LGVRTFVPKP |
VATTLQYVGG | | AAAILGLVAM | | ASDVEGLYAA | | VKALVCVVKS | | NPLASKEMER |
IKGYQLLAML | | LKKKRSLLNS | | HILHLTFSLV | | GTVDSGHETS | | IIPNSTAFQD |
LLCDFEVWLH | | APYELHLSLF | | EHFIELLTES | | SEASKNAKLM | | REFQLIPKLL |
LTLRDMSLSQ | | PTIAAISNVL | | SFLLQGFPSS | | NDLLRFGQFI | | SSTLPTFAVC |
EKFVVMEINN | | EEKLDTGTEE | | EFGGLVSANL | | ILLRNRLLDI | | LLKLIYTSKE |
KTSINLQACE | | ELVKTLGFDW | | IMMFMEEHLH | | STTVTAAMRI | | LVVLLSNQSI |
LIKFKEGLSG | | GGWLEQTDSV | | LTNKIGTVLG | | FNVGRSAGGR | | STVREINRDA |
CHFPGFPVLQ | | SFLPKHTNVP | | ALYFLLMALF | | LQQPVSELPE | | NLQVSVPVIS |
CRSKQGCQFD | | LDSIWTFIFG | | VPASSGTVVS | | SIHNVCTEAV | | FLLLGMLRSM |
LTSPWQSEEE | | GSWLREYPVT | | LMQFFRYLYH | | NVPDLASMWM | | SPDFLCALAA |
TVFPFNIRPY | | SEMVTDLDDE | | VGSPAEEFKA | | FAADTGMNRS | | QSEYCNVGTK |
TYLTNHPAKK | | FVFDFMRVLI | | IDNLCLTPAS | | KQTPLIDLLL | | EASPERSTRT |
QQKEFQTYIL | | DSVMDHLLAA | | DVLLGEDASL | | PITSGGSYQV | | LVNNVFYFTQ |
RVVDKLWQGM | | FNKESKLLID | | FIIQLIAQSK | | RRSQGLSLDA | | VYHCLNRTIL |
YQFSRAHKTV | | PQQVALLDSL | | RVLTVNRNLI | | LGPGNHDQEF | | ISCLAHCLIN |
LHVGSNVDGF | | GLEAEARMTT | | WHIMIPSDIE | | PDGSYSQDIS | | EGRQLLIKAV |
NRVWTELIHS | | KKQVLEELFK | | VTLPVNERGH | | VDIATARPLI | | EEAALKCWQN |
HLAHEKKCIS | | RGEALAPTTQ | | SKLSRVSSGF | | GLSKLTGSRR | | NRKESGLNKH |
SLSTQEISQW | | MFTHIAVVRD | | LVDTQYKEYQ | | ERQQNALKYV | | TEEWCQIECE |
LLRERGLWGP | | PIGSHLDKWM | | LEMTEGPCRM | | RKKMVRNDMF | | YNHYPYVPET |
EQETNVASEI | | PSKQPETPDD | | IPQKKPARYR | | RAVSYDSKEY | | YMRLASGNPA |
IVQDAIVESS | | EGEAAQQEPE | | HGEDTIAKVK | | GLVKPPLKRS | | RSAPDGGDEE |
NQEQLQDQIA | | EGSSIEEEEK | | TDNATLLRLL | | EEGEKIQHMY | | RCARVQGLDT |
SEGLLLFGKE | | HFYVIDGFTM | | TATREIRDIE | | TLPPNMHEPI | | IPRGARQGPS |
QLKRTCSIFA | | YEDIKEVHKR | | RYLLQPIAVE | | VFSGDGRNYL | | LAFQKGIRNK |
VYQRFLAVVP | | SLTDSSESVS | | GQRPNTSVEQ | | GSGLLSTLVG | | EKSVTQRWER |
GEISNFQYLM | | HLNTLAGRSY | | NDLMQYPVFP | | WILADYDSEE | | VDLTNPKTFR |
NLAKPMGAQT | | DERLAQYKKR | | YKDWEDPNGE | | TPAYHYGTHY | | SSAMIVASYL |
VRMEPFTQIF | | LRLQGGHFDL | | ADRMFHSVRE | | AWYSASKHNM | | ADVKELIPEF |
FYLPEFLFNS | | NNFDLGCKQN | | GTKLGDVILP | | PWAKGDPREF | | IRVHREALEC |
DYVSAHLHEW | | IDLIFGYKQQ | | GPAAVEAVNV | | FHHLFYEGQV | | DIYNINDPLK |
ETATIGFINN | | FGQIPKQLFK | | KPHPPKRVRS | | RLNGDNAGIS | | VLPGSTSDKI |
FFHHLDNLRP | | SLTPVKELKE | | PVGQIVCTDK | | GILAVEQNKV | | LIPPTWNKTF |
AWGYADLSCR | | LGTYESDKAM | | TVYECLSEWG | | QILCAICPNP | | KLVITGGTST |
VVCVWEMGTS | | KEKAKTVTLK | | QALLGHTDTV | | TCATASLAYH | | IIVSGSRDRT |
CIIWDLNKLS | | FLTQLRGHRA | | PVSALCINEL | | TGDIVSCAGT | | YIHVWSINGN |
PIVSVNTFTG | | RSQQIICCCM | | SEMNEWDTQN | | VIVTGHSDGV | | VRFWRMEFLQ |
VPETPAPEPA | | EVLEMQEDCP | | EAQIGQEAQD | | EDSSDSEADE | | QSISQDPKDT |
PSQPSSTSHR | | PRAASCRATA | | AWCTDSGSDD | | SRRWSDQLSL | | DEKDGFIFVN |
YSEGQTRAHL | | QGPLSHPHPN | | PIEVRNYSRL | | KPGYRWERQL | | VFRSKLTMHT |
AFDRKDNAHP | | AEVTALGISK | | DHSRILVGDS | | RGRVFSWSVS | | DQPGRSAADH |
WVKDEGGDSC | | SGCSVRFSLT | | ERRHHCRNCG | | QLFCQKCSRF | | QSEIKRLKIS |
SPVRVCQNCY | | YNLQHERGSE | | DGPRNC |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як автофагія, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Hocking L.J., Mellis D.J., McCabe P.S., Helfrich M.H., Rogers M.J. (2010). Functional interaction between sequestosome-1/p62 and autophagy-linked FYVE-containing protein WDFY3 in human osteoclasts. Biochem. Biophys. Res. Commun. 402: 543—548. PMID 20971078 DOI:10.1016/j.bbrc.2010.10.076
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з WDFY3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20751 (англ.) . Архів оригіналу за 28 березня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q8IZQ1 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |