VASP

VASP
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1EGX, 1USD, 1USE, 2PAV, 2PBD, 3CHW

Ідентифікатори
Символи VASP, vasodilator-stimulated phosphoprotein, vasodilator stimulated phosphoprotein
Зовнішні ІД OMIM: 601703 MGI: 109268 HomoloGene: 7592 GeneCards: VASP
Онтологія гена
Молекулярна функція

profilin binding
SH3 domain binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
actin binding
cadherin binding

Клітинна компонента

cell projection
мембрана
focal adhesion
bicellular tight junction
Філоподія
клітинна мембрана
міжклітинні контакти
actin cytoskeleton
екзосома
цитоскелет
lamellipodium membrane
lamellipodium
filopodium membrane
цитоплазма
гіалоплазма

Біологічний процес

positive regulation of actin filament polymerization
axon guidance
neural tube closure
actin polymerization or depolymerization
protein homotetramerization
actin cytoskeleton organization
cell junction assembly

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
7408
22323
Ensembl
ENSG00000125753
ENSMUSG00000030403
UniProt
P50552
P70460
RefSeq (мРНК)
NM_001008736
NM_003370
NM_001282021
NM_001282022
NM_009499
RefSeq (білок)
NP_003361
NP_001268950
NP_001268951
NP_033525
Локус (UCSC) Хр. 19: 45.51 – 45.53 Mb Хр. 7: 18.99 – 19.01 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

VASP (англ. Vasodilator-stimulated phosphoprotein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 380 амінокислот, а молекулярна маса — 39 830[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSETVICSSRATVMLYDDGNKRWLPAGTGPQAFSRVQIYHNPTANSFRVV
GRKMQPDQQVVINCAIVRGVKYNQATPNFHQWRDARQVWGLNFGSKEDAA
QFAAGMASALEALEGGGPPPPPALPTWSVPNGPSPEEVEQQKRQQPGPSE
HIERRVSNAGGPPAPPAGGPPPPPGPPPPPGPPPPPGLPPSGVPAAAHGA
GGGPPPAPPLPAAQGPGGGGAGAPGLAAAIAGAKLRKVSKQEEASGGPTA
PKAESGRSGGGGLMEEMNAMLARRRKATQVGEKTPKDESANQEEPEARVP
AQSESVRRPWEKNSTTLPRMKSSSSVTTSETQPCTPSSSDYSDLQRVKQE
LLEEVKKELQKVKEEIIEAFVQELRKRGSP

Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, щільних контактах.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Bachmann C., Fischer L., Walter U., Reinhard M. (1999). The EVH2 domain of the vasodilator-stimulated phosphoprotein mediates tetramerization, F-actin binding, and actin bundle formation. J. Biol. Chem. 274: 23549—23557. PMID 10438535 DOI:10.1074/jbc.274.33.23549
  • Wentworth J.K., Pula G., Poole A.W. (2006). Vasodilator-stimulated phosphoprotein (VASP) is phosphorylated on Ser 157 by protein kinase C-dependent and -independent mechanisms in thrombin-stimulated human platelets. Biochem. J. 393: 555—564. PMID 16197368 DOI:10.1042/BJ20050796
  • Ferron F., Rebowski G., Lee S.H., Dominguez R. (2007). Structural basis for the recruitment of profilin-actin complexes during filament elongation by Ena/VASP. EMBO J. 26: 4597—4606. PMID 17914456 DOI:10.1038/sj.emboj.7601874

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12652 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  4. UniProt, P50552 (англ.) . Архів оригіналу за 19 березня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

  • Хромосома 19
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»