SCG2

Ідентифікатори

Символи

SCG2, CHGC, SN, SgII, secretogranin II

Зовнішні ІД

OMIM: 118930 MGI: 103033 HomoloGene: 2591 GeneCards: SCG2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • chemoattractant activity • cytokine activity
Клітинна компонента	• extracellular region • dense core granule • secretory granule • міжклітинний простір • neuronal dense core vesicle • endoplasmic reticulum lumen
Біологічний процес	• protein secretion • induction of positive chemotaxis • negative regulation of endothelial cell apoptotic process • eosinophil chemotaxis • positive chemotaxis • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway • GO:0007243 intracellular signal transduction • inflammatory response • positive regulation of endothelial cell proliferation • endothelial cell migration • Ангіогенез • MAPK cascade • negative regulation of endothelial cell proliferation • посттрансляційна модифікація • regulation of signaling receptor activity
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7857


20254

Ensembl


ENSG00000171951


ENSMUSG00000050711

UniProt


P13521 P15321


Q03517

RefSeq (мРНК)


NM_003469


NM_009129 NM_001310680

RefSeq (білок)


NP_003460


NP_001297609 NP_033155

Локус (UCSC)

Хр. 2: 223.6 – 223.6 Mb

Хр. 1: 79.41 – 79.42 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SCG2 (англ. Secretogranin II) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 617 амінокислот, а молекулярна маса — 70 941^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAEAKTHWLG	AALSLIPLIF	LISGAEAASF	QRNQLLQKEP	DLRLENVQKF
PSPEMIRALE	YIENLRQQAH	KEESSPDYNP	YQGVSVPLQQ	KENGDESHLP
ERDSLSEEDW	MRIILEALRQ	AENEPQSAPK	ENKPYALNSE	KNFPMDMSDD
YETQQWPERK	LKHMQFPPMY	EENSRDNPFK	RTNEIVEEQY	TPQSLATLES
VFQELGKLTG	PNNQKRERMD	EEQKLYTDDE	DDIYKANNIA	YEDVVGGEDW
NPVEEKIESQ	TQEEVRDSKE	NIEKNEQIND	EMKRSGQLGI	QEEDLRKESK
DQLSDDVSKV	IAYLKRLVNA	AGSGRLQNGQ	NGERATRLFE	KPLDSQSIYQ
LIEISRNLQI	PPEDLIEMLK	TGEKPNGSVE	PERELDLPVD	LDDISEADLD
HPDLFQNRML	SKSGYPKTPG	RAGTEALPDG	LSVEDILNLL	GMESAANQKT
SYFPNPYNQE	KVLPRLPYGA	GRSRSNQLPK	AAWIPHVENR	QMAYENLNDK
DQELGEYLAR	MLVKYPEIIN	SNQVKRVPGQ	GSSEDDLQEE	EQIEQAIKEH
LNQGSSQETD	KLAPVSKRFP	VGPPKNDDTP	NRQYWDEDLL	MKVLEYLNQE
KAEKGREHIA	KRAMENM

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Beranova-Giorgianni S., Zhao Y., Desiderio D.M., Giorgianni F. (2006). Phosphoproteomic analysis of the human pituitary. Pituitary. 9: 109—120. PMID 16807684 DOI:10.1007/s11102-006-8916-x
Halim A., Ruetschi U., Larson G., Nilsson J. (2013). LC-MS/MS characterization of O-glycosylation sites and glycan structures of human cerebrospinal fluid glycoproteins. J. Proteome Res. 12: 573—584. PMID 23234360 DOI:10.1021/pr300963h

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10575 (англ.) . Архів оригіналу за 16 березня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, P13521 (англ.) . Архів оригіналу за 30 липня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.