SCAP (ген)

SCAP

Ідентифікатори

Символи

SCAP, entrez:22937, SREBF chaperone

Зовнішні ІД

OMIM: 601510 MGI: 2135958 HomoloGene: 8160 GeneCards: SCAP

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cholesterol binding • unfolded protein binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • sterol binding
Клітинна компонента	• endoplasmic reticulum membrane • ER to Golgi transport vesicle membrane • integral component of membrane • комплекс Ґольджі • мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела • Golgi membrane • ендоплазматичний ретикулум • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• response to hypoxia • GO:0010260 старіння людини • cholesterol metabolic process • response to insulin • regulation of fatty acid biosynthetic process • negative regulation of cholesterol biosynthetic process • steroid metabolic process • lipid metabolism • regulation of fatty acid metabolic process • SREBP signaling pathway • regulation of cholesterol biosynthetic process • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • cellular lipid metabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


22937


235623

Ensembl


ENSG00000114650


ENSMUSG00000032485

UniProt


Q12770


Q6GQT6

RefSeq (мРНК)


NM_012235 NM_001320044


NM_001001144 NM_001103162

RefSeq (білок)


NP_001306973 NP_036367


NP_001001144 NP_001096632

Локус (UCSC)

Хр. 3: 47.41 – 47.48 Mb

Хр. 9: 110.16 – 110.21 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SCAP (англ. SREBF chaperone) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 279 амінокислот, а молекулярна маса — 139 729^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTLTERLREK	ISRAFYNHGL	LCASYPIPII	LFTGFCILAC	CYPLLKLPLP
GTGPVEFTTP	VKDYSPPPVD	SDRKQGEPTE	QPEWYVGAPV	AYVQQIFVKS
SVFPWHKNLL	AVDVFRSPLS	RAFQLVEEIR	NHVLRDSSGI	RSLEELCLQV
TDLLPGLRKL	RNLLPEHGCL	LLSPGNFWQN	DWERFHADPD	IIGTIHQHEP
KTLQTSATLK	DLLFGVPGKY	SGVSLYTRKR	MVSYTITLVF	QHYHAKFLGS
LRARLMLLHP	SPNCSLRAES	LVHVHFKEEI	GVAELIPLVT	TYIILFAYIY
FSTRKIDMVK	SKWGLALAAV	VTVLSSLLMS	VGLCTLFGLT	PTLNGGEIFP
YLVVVIGLEN	VLVLTKSVVS	TPVDLEVKLR	IAQGLSSESW	SIMKNMATEL
GIILIGYFTL	VPAIQEFCLF	AVVGLVSDFF	LQMLFFTTVL	SIDIRRMELA
DLNKRLPPEA	CLPSAKPVGQ	PTRYERQLAV	RPSTPHTITL	QPSSFRNLRL
PKRLRVVYFL	ARTRLAQRLI	MAGTVVWIGI	LVYTDPAGLR	NYLAAQVTEQ
SPLGEGALAP	MPVPSGMLPP	SHPDPAFSIF	PPDAPKLPEN	QTSPGESPER
GGPAEVVHDS	PVPEVTWGPE	DEELWRKLSF	RHWPTLFSYY	NITLAKRYIS
LLPVIPVTLR	LNPREALEGR	HPQDGRSAWP	PPGPIPAGHW	EAGPKGPGGV
QAHGDVTLYK	VAALGLATGI	VLVLLLLCLY	RVLCPRNYGQ	LGGGPGRRRR
GELPCDDYGY	APPETEIVPL	VLRGHLMDIE	CLASDGMLLV	SCCLAGHVCV
WDAQTGDCLT	RIPRPGRQRR	DSGVGSGLEA	QESWERLSDG	GKAGPEEPGD
SPPLRHRPRG	PPPPSLFGDQ	PDLTCLIDTN	FSAQPRSSQP	TQPEPRHRAV
CGRSRDSPGY	DFSCLVQRVY	QEEGLAAVCT	PALRPPSPGP	VLSQAPEDEG
GSPEKGSPSL	AWAPSAEGSI	WSLELQGNLI	VVGRSSGRLE	VWDAIEGVLC
CSSEEVSSGI	TALVFLDKRI	VAARLNGSLD	FFSLETHTAL	SPLQFRGTPG
RGSSPASPVY	SSSDTVACHL	THTVPCAHQK	PITALKAAAG	RLVTGSQDHT
LRVFRLEDSC	CLFTLQGHSG	AITTVYIDQT	MVLASGGQDG	AICLWDVLTG
SRVSHVFAHR	GDVTSLTCTT	SCVISSGLDD	LISIWDRSTG	IKFYSIQQDL
GCGASLGVIS	DNLLVTGGQG	CVSFWDLNYG	DLLQTVYLGK	NSEAQPARQI
LVLDNAAIVC	NFGSELSLVY	VPSVLEKLD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як метаболізм ліпідів, метаболізм холестеролу, метаболізм стероїдів, метаболізм стеролів, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.

Література

Nakajima T., Hamakubo T., Kodama T., Inazawa J., Emi M. (1999). Genomic structure and chromosomal mapping of the human sterol regulatory element binding protein (SREBP) cleavage-activating protein (SCAP) gene. J. Hum. Genet. 44: 402—407. PMID 10570913 DOI:10.1007/s100380050187
Nagase T., Seki N., Ishikawa K., Tanaka A., Nomura N. (1996). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. V. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0161-KIAA0200) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 3: 17—24. PMID 8724849 DOI:10.1093/dnares/3.1.17
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Irisawa M., Inoue J., Ozawa N., Mori K., Sato R. (2009). The sterol-sensing endoplasmic reticulum (ER) membrane protein TRC8 hampers ER to Golgi transport of sterol regulatory element-binding protein-2 (SREBP-2)/SREBP cleavage-activated protein and reduces SREBP-2 cleavage. J. Biol. Chem. 284: 28995—29004. PMID 19706601 DOI:10.1074/jbc.M109.041376
Iwaki K., Nakajima T., Ota N., Emi M. (1999). A common Ile796Val polymorphism of the human SREBP cleavage-activating protein (SCAP) gene. J. Hum. Genet. 44: 421—422. PMID 10570919 DOI:10.1007/s100380050193

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30634 (англ.) . Архів оригіналу за 15 лютого 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q12770 (англ.) . Архів оригіналу за 10 лютого 2017. Процитовано 30 серпня 2017.