RBM47

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2DIS

Ідентифікатори

Символи

RBM47, NET18, RNA binding motif protein 47

Зовнішні ІД

MGI: 2384294 HomoloGene: 36932 GeneCards: RBM47

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleic acid binding • RNA binding • mRNA binding
Клітинна компонента	• клітинне ядро
Біологічний процес	• hematopoietic progenitor cell differentiation • cytidine to uridine editing
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


54502


245945

Ensembl


ENSG00000163694


ENSMUSG00000070780

UniProt


A0AV96


Q91WT8

RefSeq (мРНК)


NM_001098634 NM_019027 NM_001371113 NM_001371114


NM_001127382 NM_001291226 NM_139065 NM_178446

RefSeq (білок)


NP_001092104 NP_061900 NP_001358042 NP_001358043


NP_001120854 NP_001278155 NP_620704 NP_848541

Локус (UCSC)

Хр. 4: 40.42 – 40.63 Mb

Хр. 5: 66.17 – 66.33 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RBM47 (англ. RNA binding motif protein 47) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 593 амінокислот, а молекулярна маса — 64 099^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTAEDSTAAM	SSDSAAGSSA	KVPEGVAGAP	NEAALLALME	RTGYSMVQEN
GQRKYGGPPP	GWEGPHPQRG	CEVFVGKIPR	DVYEDELVPV	FEAVGRIYEL
RLMMDFDGKN	RGYAFVMYCH	KHEAKRAVRE	LNNYEIRPGR	LLGVCCSVDN
CRLFIGGIPK	MKKREEILEE	IAKVTEGVLD	VIVYASAADK	MKNRGFAFVE
YESHRAAAMA	RRKLMPGRIQ	LWGHQIAVDW	AEPEIDVDED	VMETVKILYV
RNLMIETTED	TIKKSFGQFN	PGCVERVKKI	RDYAFVHFTS	REDAVHAMNN
LNGTELEGSC	LEVTLAKPVD	KEQYSRYQKA	ARGGGAAEAA	QQPSYVYSCD
PYTLAYYGYP	YNALIGPNRD	YFVKAGSIRG	RGRGAAGNRA	PGPRGSYLGG
YSAGRGIYSR	YHEGKGKQQE	KGYELVPNLE	IPTVNPVAIK	PGTVAIPAIG
AQYSMFPAAP	APKMIEDGKI	HTVEHMISPI	AVQPDPASAA	AAAAAAAAAA
AAVIPTVSTP	PPFQGRPITP	VYTVAPNVQR	IPTAGIYGAS	YVPFAAPATA
TIATLQKNAA	AAAAMYGGYA	GYIPQAFPAA	AIQVPIPDVY	QTY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30358 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, A0AV96 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.