PSMC2

Ідентифікатори

Символи

PSMC2, MSS1, Nbla10058, S7, proteasome 26S subunit, ATPase 2, RPT1

Зовнішні ІД

OMIM: 154365 MGI: 109555 HomoloGene: 2096 GeneCards: PSMC2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • ATPase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • TBP-class protein binding • ATP binding • hydrolase activity • proteasome-activating activity
Клітинна компонента	• nuclear proteasome complex • proteasome regulatory particle, base subcomplex • мембрана • proteasome accessory complex • нуклеоплазма • cytosolic proteasome complex • Протеасома • клітинне ядро • extracellular region • цитоплазма • гіалоплазма • secretory granule lumen • ficolin-1-rich granule lumen • P-body • cytoplasmic ribonucleoprotein granule • dendritic spine
Біологічний процес	• positive regulation of RNA polymerase II transcription preinitiation complex assembly • regulation of cellular amino acid metabolic process • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of mRNA stability • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • protein polyubiquitination • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • MAPK cascade • Fc-epsilon receptor signaling pathway • GO:0044257 protein catabolic process • NIK/NF-kappaB signaling • osteoblast differentiation • ubiquitin-dependent ERAD pathway • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process • T cell receptor signaling pathway • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • GO:0022415 viral process • positive regulation of proteasomal protein catabolic process • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • protein deubiquitination • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • neutrophil degranulation • трансмембранний транспорт • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • посттрансляційна модифікація • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • interleukin-1-mediated signaling pathway • regulation of mitotic cell cycle phase transition
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5701


19181

Ensembl


ENSG00000161057


ENSMUSG00000028932

UniProt


P35998


P46471 Q8BVQ9

RefSeq (мРНК)


NM_001204453 NM_002803


NM_011188 NM_001368661

RefSeq (білок)


NP_001191382 NP_002794


NP_035318 NP_001355590

Локус (UCSC)

Хр. 7: 103.33 – 103.37 Mb

Хр. 5: 21.99 – 22.01 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PSMC2 (англ. Proteasome 26S subunit, ATPase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 433 амінокислот, а молекулярна маса — 48 634^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPDYLGADQR	KTKEDEKDDK	PIRALDEGDI	ALLKTYGQST	YSRQIKQVED
DIQQLLKKIN	ELTGIKESDT	GLAPPALWDL	AADKQTLQSE	QPLQVARCTK
IINADSEDPK	YIINVKQFAK	FVVDLSDQVA	PTDIEEGMRV	GVDRNKYQIH
IPLPPKIDPT	VTMMQVEEKP	DVTYSDVGGC	KEQIEKLREV	VETPLLHPER
FVNLGIEPPK	GVLLFGPPGT	GKTLCARAVA	NRTDACFIRV	IGSELVQKYV
GEGARMVREL	FEMARTKKAC	LIFFDEIDAI	GGARFDDGAG	GDNEVQRTML
ELINQLDGFD	PRGNIKVLMA	TNRPDTLDPA	LMRPGRLDRK	IEFSLPDLEG
RTHIFKIHAR	SMSVERDIRF	ELLARLCPNS	TGAEIRSVCT	EAGMFAIRAR
RKIATEKDFL	EAVNKVIKSY	AKFSATPRYM	TYN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Dubiel W., Ferrell K., Rechsteiner M. (1993). Peptide sequencing identifies MSS1, a modulator of HIV Tat-mediated transactivation, as subunit 7 of the 26 S protease. FEBS Lett. 323: 276—278. PMID 8500623 DOI:10.1016/0014-5793(93)81356-5
Chen Y., Sharp Z.D., Lee W.-H. (1997). HEC binds to the seventh regulatory subunit of the 26 S proteasome and modulates the proteolysis of mitotic cyclins. J. Biol. Chem. 272: 24081—24087. PMID 9295362 DOI:10.1074/jbc.272.38.24081
Zheng L., Chen Y., Lee W.-H. (1999). Hec1p, an evolutionarily conserved coiled-coil protein, modulates chromosome segregation through interaction with SMC proteins. Mol. Cell. Biol. 19: 5417—5428. PMID 10409732 DOI:10.1128/MCB.19.8.5417
Huang X., Luan B., Wu J., Shi Y. (2016). An atomic structure of the human 26S proteasome. Nat. Struct. Mol. Biol. 23: 778—785. PMID 27428775 DOI:10.1038/nsmb.3273

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9548 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P35998 (англ.) . Архів оригіналу за 4 червня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.