PPFIBP1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3TAD

Ідентифікатори

Символи

PPFIBP1, L2, SGT2, hSGT2, hSgt2p, PPFIA binding protein 1

Зовнішні ІД

OMIM: 603141 MGI: 1914783 HomoloGene: 2685 GeneCards: PPFIBP1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• cadherin binding
Клітинна компонента	• клітинна мембрана • focal adhesion • гіалоплазма
Біологічний процес	• адгезія клітин
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8496


67533

Ensembl


ENSG00000110841


ENSMUSG00000016487

UniProt


Q86W92


Q8C8U0

RefSeq (мРНК)


NM_001198915 NM_001198916 NM_003622 NM_177444


NM_001170433 NM_026221 NM_001355728 NM_001355729

RefSeq (білок)


NP_001185844 NP_001185845 NP_003613 NP_803193


NP_001163904 NP_080497 NP_001342657 NP_001342658

Локус (UCSC)

Хр. 12: 27.52 – 27.7 Mb

Хр. 6: 146.79 – 146.93 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PPFIBP1 (англ. PPFIA binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 011 амінокислот, а молекулярна маса — 114 024^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MMSDASDMLA	AALEQMDGII	AGSKALEYSN	GIFDCQSPTS	PFMGSLRALH
LVEDLRGLLE	MMETDEKEGL	RCQIPDSTAE	TLVEWLQSQM	TNGHLPGNGD
VYQERLARLE	NDKESLVLQV	SVLTDQVEAQ	GEKIRDLEFC	LEEHREKVNA
TEEMLQQELL	SRTSLETQKL	DLMAEISNLK	LKLTAVEKDR	LDYEDKFRDT
EGLIQEINDL	RLKVSEMDSE	RLQYEKKLKS	TKSLMAKLSS	MKIKVGQMQY
EKQRMEQKWE	SLKDELASLK	EQLEEKESEV	KRLQEKLVCK	MKGEGVEIVD
RDIEVQKMKK	AVESLMAANE	EKDRKIEDLR	QCLNRYKKMQ	DTVVLAQGKD
GEYEELLNSS	SISSLLDAQG	FSDLEKSPSP	TPVMGSPSCD	PFNTSVPEEF
HTTILQVSIP	SLLPATVSME	TSEKSKLTPK	PETSFEENDG	NIILGATVDT
QLCDKLLTSS	LQKSSSLGNL	KKETSDGEKE	TIQKTSEDRA	PAESRPFGTL
PPRPPGQDTS	MDDNPFGTRK	VRSSFGRGFF	KIKSNKRTAS	APNLAETEKE
TAEHLDLAGA	SSRPKDSQRN	SPFQIPPPSP	DSKKKSRGIM	KLFGKLRRSQ
STTFNPDDMS	EPEFKRGGTR	ATAGPRLGWS	RDLGQSNSDL	DMPFAKWTKE
QVCNWLMEQG	LGSYLNSGKH	WIASGQTLLQ	ASQQDLEKEL	GIKHSLHRKK
LQLALQALGS	EEETNHGKLD	FNWVTRWLDD	IGLPQYKTQF	DEGRVDGRML
HYMTVDDLLS	LKVVSVLHHL	SIKRAIQVLR	INNFEPNCLR	RRPSDENTIA
PSEVQKWTNH	RVMEWLRSVD	LAEYAPNLRG	SGVHGGLMVL	EPRFNVETMA
QLLNIPPNKT	LLRRHLATHF	NLLIGAEAQH	QKRDAMELPD	YVLLTATAKV
KPKKLAFSNF	GNLRKKKQED	GEEYVCPMEL	GQASGSASKK	GFKPGLDMRL
YEEDDLDRLE	QMEDSEGTVR	QIGAFSEGIN	NLTHMLKEDD	MFKDFAARSP
SASITDEDSN	V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг.

Література

Serra-Pages C., Medley Q.G., Tang M., Hart A., Streuli M. (1998). Liprins, a family of LAR transmembrane protein-tyrosine phosphatase-interacting proteins. J. Biol. Chem. 273: 15611—15620. PMID 9624153 DOI:10.1074/jbc.273.25.15611
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9249 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q86W92 (англ.) . Архів оригіналу за 24 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.