ITGA1

ITGA1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1PT6, 1QC5, 1QCY, 2L8S, 4A0Q, 2M32

Ідентифікатори
Символи ITGA1, CD49a, VLA1, integrin subunit alpha 1
Зовнішні ІД OMIM: 192968 MGI: 96599 HomoloGene: 57137 GeneCards: ITGA1
Онтологія гена
Молекулярна функція

• collagen binding
• зв'язування з іоном металу
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• collagen binding involved in cell-matrix adhesion
• protein phosphatase binding
• signaling receptor binding

Клітинна компонента

• integral component of membrane
• перикаріон
• integrin alpha1-beta1 complex
• мембрана
• focal adhesion
• basal part of cell
• клітинна мембрана
• cell surface
• integrin complex
• Акросома
• membrane raft
• neuron projection
• екзосома
• external side of plasma membrane

Біологічний процес

• neuron projection morphogenesis
• м'язове скорочення
• negative regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway
• extracellular matrix organization
• вазодилатація
• neutrophil chemotaxis
• positive regulation of neuron apoptotic process
• positive regulation of phosphoprotein phosphatase activity
• адгезія клітин
• cell chemotaxis
• integrin-mediated signaling pathway
• cellular extravasation
• cell-matrix adhesion
• negative regulation of cell population proliferation

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3672
109700
Ensembl
ENSG00000213949
ENSMUSG00000042284
UniProt
P56199
Q3V3R4
RefSeq (мРНК)
NM_181501
NM_001033228
RefSeq (білок)
NP_852478
NP_001028400
Локус (UCSC) Хр. 5: 52.79 – 52.96 Mb Хр. 13: 115.09 – 115.24 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ITGA1 (англ. Integrin subunit alpha 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 179 амінокислот, а молекулярна маса — 130 848[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAPRPRARPGVAVACCWLLTVVLRCCVSFNVDVKNSMTFSGPVEDMFGYT
VQQYENEEGKWVLIGSPLVGQPKNRTGDVYKCPVGRGESLPCVKLDLPVN
TSIPNVTEVKENMTFGSTLVTNPNGGFLACGPLYAYRCGHLHYTTGICSD
VSPTFQVVNSIAPVQECSTQLDIVIVLDGSNSIYPWDSVTAFLNDLLERM
DIGPKQTQVGIVQYGENVTHEFNLNKYSSTEEVLVAAKKIVQRGGRQTMT
ALGIDTARKEAFTEARGARRGVKKVMVIVTDGESHDNHRLKKVIQDCEDE
NIQRFSIAILGSYNRGNLSTEKFVEEIKSIASEPTEKHFFNVSDELALVT
IVKTLGERIFALEATADQSAASFEMEMSQTGFSAHYSQDWVMLGAVGAYD
WNGTVVMQKASQIIIPRNTTFNVESTKKNEPLASYLGYTVNSATASSGDV
LYIAGQPRYNHTGQVIIYRMEDGNIKILQTLSGEQIGSYFGSILTTTDID
KDSNTDILLVGAPMYMGTEKEEQGKVYVYALNQTRFEYQMSLEPIKQTCC
SSRQHNSCTTENKNEPCGARFGTAIAAVKDLNLDGFNDIVIGAPLEDDHG
GAVYIYHGSGKTIRKEYAQRIPSGGDGKTLKFFGQSIHGEMDLNGDGLTD
VTIGGLGGAALFWSRDVAVVKVTMNFEPNKVNIQKKNCHMEGKETVCINA
TVCFDVKLKSKEDTIYEADLQYRVTLDSLRQISRSFFSGTQERKVQRNIT
VRKSECTKHSFYMLDKHDFQDSVRITLDFNLTDPENGPVLDDSLPNSVHE
YIPFAKDCGNKEKCISDLSLHVATTEKDLLIVRSQNDKFNVSLTVKNTKD
SAYNTRTIVHYSPNLVFSGIEAIQKDSCESNHNITCKVGYPFLRRGEMVT
FKILFQFNTSYLMENVTIYLSATSDSEEPPETLSDNVVNISIPVKYEVGL
QFYSSASEYHISIAANETVPEVINSTEDIGNEINIFYLIRKSGSFPMPEL
KLSISFPNMTSNGYPVLYPTGLSSSENANCRPHIFEDPFSINSGKKMTTS
TDHLKRGTILDCNTCKFATITCNLTSSDISQVNVSLILWKPTFIKSYFSS
LNLTIRGELRSENASLVLSSSNQKRELAIQISKDGLPGRVPLWVILLSAF
AGLLLLMLLILALWKIGFFKRPLKKKMEK

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, інтегринів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, іоном магнію. Локалізований у мембрані.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Briesewitz R., Epstein M.R., Marcantonio E.E. (1993). Expression of native and truncated forms of the human integrin alpha 1 subunit. J. Biol. Chem. 268: 2989—2996. PMID 8428973

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6134 (англ.) . Процитовано 31 серпня 2017.
  4. ↑ UniProt, P56199 (англ.) . Архів оригіналу за 28 серпня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 5
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Білки: кластери диференціації
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350