IFIH1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2RQB, 3B6E, 3GA3, 4GL2 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | IFIH1, AGS7, Hlcd, IDDM19, MDA-5, MDA5, RLR-2, SGMRT1, interferon induced with helicase C domain 1, IMD95 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606951 MGI: 1918836 HomoloGene: 32535 GeneCards: IFIH1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
цукровий діабет 1-го типу, type 1 diabetes mellitus 19, Singleton-Merten syndrome 1, Singleton Merten syndrome, Aicardi-Goutieres syndrome[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • nucleotide binding • GO:0008026 helicase activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • single-stranded RNA binding • RNA binding • double-stranded RNA binding • ribonucleoprotein complex binding • hydrolase activity • ATP binding • identical protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • positive regulation of interferon-alpha production • MDA-5 signaling pathway • процес імунної системи • response to virus • protein sumoylation • cytoplasmic pattern recognition receptor signaling pathway in response to virus • negative regulation of type I interferon production • detection of virus • GO:0022415 viral process • вроджений імунітет • regulation of type III interferon production • positive regulation of interferon-beta production • protein deubiquitination • positive regulation of response to cytokine stimulus • cellular response to exogenous dsRNA • defense response to virus |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 162.27 – 162.32 Mb | Хр. 2: 62.43 – 62.48 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
IFIH1 (англ. Interferon induced with helicase C domain 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 025 амінокислот, а молекулярна маса — 116 689[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSNGYSTDEN | | FRYLISCFRA | | RVKMYIQVEP | | VLDYLTFLPA | | EVKEQIQRTV |
ATSGNMQAVE | | LLLSTLEKGV | | WHLGWTREFV | | EALRRTGSPL | | AARYMNPELT |
DLPSPSFENA | | HDEYLQLLNL | | LQPTLVDKLL | | VRDVLDKCME | | EELLTIEDRN |
RIAAAENNGN | | ESGVRELLKR | | IVQKENWFSA | | FLNVLRQTGN | | NELVQELTGS |
DCSESNAEIE | | NLSQVDGPQV | | EEQLLSTTVQ | | PNLEKEVWGM | | ENNSSESSFA |
DSSVVSESDT | | SLAEGSVSCL | | DESLGHNSNM | | GSDSGTMGSD | | SDEENVAARA |
SPEPELQLRP | | YQMEVAQPAL | | EGKNIIICLP | | TGSGKTRVAV | | YIAKDHLDKK |
KKASEPGKVI | | VLVNKVLLVE | | QLFRKEFQPF | | LKKWYRVIGL | | SGDTQLKISF |
PEVVKSCDII | | ISTAQILENS | | LLNLENGEDA | | GVQLSDFSLI | | IIDECHHTNK |
EAVYNNIMRH | | YLMQKLKNNR | | LKKENKPVIP | | LPQILGLTAS | | PGVGGATKQA |
KAEEHILKLC | | ANLDAFTIKT | | VKENLDQLKN | | QIQEPCKKFA | | IADATREDPF |
KEKLLEIMTR | | IQTYCQMSPM | | SDFGTQPYEQ | | WAIQMEKKAA | | KEGNRKERVC |
AEHLRKYNEA | | LQINDTIRMI | | DAYTHLETFY | | NEEKDKKFAV | | IEDDSDEGGD |
DEYCDGDEDE | | DDLKKPLKLD | | ETDRFLMTLF | | FENNKMLKRL | | AENPEYENEK |
LTKLRNTIME | | QYTRTEESAR | | GIIFTKTRQS | | AYALSQWITE | | NEKFAEVGVK |
AHHLIGAGHS | | SEFKPMTQNE | | QKEVISKFRT | | GKINLLIATT | | VAEEGLDIKE |
CNIVIRYGLV | | TNEIAMVQAR | | GRARADESTY | | VLVAHSGSGV | | IEHETVNDFR |
EKMMYKAIHC | | VQNMKPEEYA | | HKILELQMQS | | IMEKKMKTKR | | NIAKHYKNNP |
SLITFLCKNC | | SVLACSGEDI | | HVIEKMHHVN | | MTPEFKELYI | | VRENKALQKK |
CADYQINGEI | | ICKCGQAWGT | | MMVHKGLDLP | | CLKIRNFVVV | | FKNNSTKKQY |
KKWVELPITF | | PNLDYSECCL | | FSDED |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, антивірусний захист, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Bamming D., Horvath C.M. (2009). Regulation of signal transduction by enzymatically inactive antiviral RNA helicase proteins MDA5, RIG-I, and LGP2. J. Biol. Chem. 284: 9700—9712. PMID 19211564 DOI:10.1074/jbc.M807365200
- Loo Y.M., Gale M. Jr. (2011). Immune signaling by RIG-I-like receptors. Immunity. 34: 680—692. PMID 21616437 DOI:10.1016/j.immuni.2011.05.003
- Kato H., Takahasi K., Fujita T. (2011). RIG-I-like receptors: cytoplasmic sensors for non-self RNA. Immunol. Rev. 243: 91—98. PMID 21884169 DOI:10.1111/j.1600-065X.2011.01052.x
- Onoguchi K., Yoneyama M., Fujita T. (2011). Retinoic acid-inducible gene-I-like receptors. J. Interferon Cytokine Res. 31: 27—31. PMID 20950133 DOI:10.1089/jir.2010.0057
- Miyashita M., Oshiumi H., Matsumoto M., Seya T. (2011). DDX60, a DEXD/H box helicase, is a novel antiviral factor promoting RIG-I-like receptor-mediated signaling. Mol. Cell. Biol. 31: 3802—3819. PMID 21791617 DOI:10.1128/MCB.01368-10
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з IFIH1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18873 (англ.) . Архів оригіналу за 4 квітня 2015. Процитовано 29 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9BYX4 (англ.) . Архів оригіналу за 26 серпня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |