HAVCR1

HAVCR1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

5DZO, 5F70

Ідентифікатори
Символи HAVCR1, HAVCR, HAVCR-1, KIM-1, KIM1, TIM, TIM-1, TIM1, TIMD-1, TIMD1, CD365, hepatitis A virus cellular receptor 1
Зовнішні ІД OMIM: 606518 MGI: 2159680 HomoloGene: 134424 GeneCards: HAVCR1
Онтологія гена
Молекулярна функція

• virus receptor activity

Клітинна компонента

• integral component of membrane
• motile cilium
• мембрана

Біологічний процес

• GO:0022415 viral process
• viral entry into host cell

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
26762
171283
Ensembl
ENSG00000113249
ENSMUSG00000040405
UniProt
Q96D42
Q5QNS5
RefSeq (мРНК)
NM_001099414
NM_001173393
NM_001308156
NM_012206
NM_001166631
NM_001166632
NM_134248
RefSeq (білок)
NP_001166864
NP_001295085
NP_036338
NP_001160103
NP_001160104
NP_599009
Локус (UCSC) Хр. 5: 157.03 – 157.06 Mb Хр. 11: 46.63 – 46.67 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

HAVCR1 (англ. Hepatitis A virus cellular receptor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 359 амінокислот, а молекулярна маса — 38 720[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MHPQVVILSLILHLADSVAGSVKVGGEAGPSVTLPCHYSGAVTSMCWNRG
SCSLFTCQNGIVWTNGTHVTYRKDTRYKLLGDLSRRDVSLTIENTAVSDS
GVYCCRVEHRGWFNDMKITVSLEIVPPKVTTTPIVTTVPTVTTVRTSTTV
PTTTTVPTTTVPTTMSIPTTTTVLTTMTVSTTTSVPTTTSIPTTTSVPVT
TTVSTFVPPMPLPRQNHEPVATSPSSPQPAETHPTTLQGAIRREPTSSPL
YSYTTDGNDTVTESSDGLWNNNQTQLFLEHSLLTANTTKGIYAGVCISVL
VLLALLGVIIAKKYFFKKEVQQLSVSFSSLQIKALQNAVEKEVQAEDNIY
IENSLYATD

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, поліморфізм. Локалізований у мембрані.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Feigelstock D., Thompson P., Mattoo P., Zhang Y., Kaplan G.G. (1998). The human homolog of HAVcr-1 codes for a hepatitis A virus cellular receptor. J. Virol. 72: 6621—6628. PMID 9658108

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17866 (англ.) . Архів оригіналу за 9 червня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
  4. ↑ UniProt, Q96D42 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 5
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.