H1FOO |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | H1-8, osH1, H1.8, H1oo, H1 histone family member O, oocyte specific, H1 histone family member O oocyte specific, H1.8 linker histone, H1FOO |
---|
Зовнішні ІД | MGI: 2176207 HomoloGene: 51377 GeneCards: H1-8 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • nucleosomal DNA binding • double-stranded DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • Нуклеосома • екзосома • ядерце • клітинне ядро • хромосома • female germ cell nucleus |
---|
Біологічний процес | • nucleosome assembly • GO:0007126 мейоз • regulation of DNA methylation • negative regulation of stem cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • chromosome condensation • negative regulation of DNA recombination |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 129.54 – 129.55 Mb | Хр. 6: 115.92 – 115.93 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
H1FOO (англ. H1 histone family member O oocyte specific) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 346 амінокислот, а молекулярна маса — 35 813[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAPGSVTSDI | | SPSSTSTAGS | | SRSPESEKPG | | PSHGGVPPGG | | PSHSSLPVGR |
RHPPVLRMVL | | EALQAGEQRR | | GTSVAAIKLY | | ILHKYPTVDV | | LRFKYLLKQA |
LATGMRRGLL | | ARPLNSKARG | | ATGSFKLVPK | | HKKKIQPRKM | | APATAPRRAG |
EAKGKGPKKP | | SEAKEDPPNV | | GKVKKAAKRP | | AKVQKPPPKP | | GAATEKARKQ |
GGAAKDTRAQ | | SGEARKVPPK | | PDKAMRAPSS | | AGGLSRKAKA | | KGSRSSQGDA |
EAYRKTKAES | | KSSKPTASKV | | KNGAASPTKK | | KVVAKAKAPK | | AGQGPNTKAA |
APAKGSGSKV | | VPAHLSRKTE | | APKGPRKAGL | | PIKASSSKVS | | SQRAEA |
Задіяний у таких біологічних процесах як мейоз, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах.
Література
- Tanaka Y., Kato S., Tanaka M., Kuji N., Yoshimura Y. (2003). Structure and expression of the human oocyte-specific histone H1 gene elucidated by direct RT-nested PCR of a single oocyte. Biochem. Biophys. Res. Commun. 304: 351—357. PMID 12711322 DOI:10.1016/S0006-291X(03)00610-7
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18463 (англ.) . Архів оригіналу за 17 жовтня 2015. Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q8IZA3 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |