GGA1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1J2J, 1JWF, 1JWG, 1NA8, 1NAF, 1NWM, 1O3X, 1OM9, 1OXZ, 1PY1, 1UJJ, 1UJK, 1X79, 2DWX, 2DWY, 3G2S, 3G2T, 3G2U, 3G2V, 3G2W

Ідентифікатори

Символи

GGA1, golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 1

Зовнішні ІД

OMIM: 606004 MGI: 2146207 HomoloGene: 39250 GeneCards: GGA1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • молекулярна функція
Клітинна компонента	• ендосома • комплекс Ґольджі • endosome membrane • внутрішньоклітинний • мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела • clathrin adaptor complex • нуклеоплазма • early endosome membrane • early endosome • гіалоплазма • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• protein transport • intracellular protein transport • toxin transport • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process • vesicle-mediated transport • GO:0015915 транспорт • Golgi to plasma membrane transport • GO:0034613 protein localization • protein localization to cell surface • retrograde transport, endosome to Golgi • Golgi to plasma membrane protein transport • protein localization to ciliary membrane
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


26088


106039

Ensembl


ENSG00000100083


ENSMUSG00000033128

UniProt


Q9UJY5


Q8R0H9

RefSeq (мРНК)

NM_001001560 NM_001001561 NM_001172687 NM_001172688 NM_013365
NM_001363771


NM_145929

RefSeq (білок)


NP_001001560 NP_001166158 NP_001166159 NP_037497 NP_001350700


NP_666041

Локус (UCSC)

Хр. 22: 37.61 – 37.63 Mb

Хр. 15: 78.76 – 78.78 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

GGA1 (англ. Golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 639 амінокислот, а молекулярна маса — 70 384^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEPAMEPETL	EARINRATNP	LNKELDWASI	NGFCEQLNED	FEGPPLATRL
LAHKIQSPQE	WEAIQALTVL	ETCMKSCGKR	FHDEVGKFRF	LNELIKVVSP
KYLGSRTSEK	VKNKILELLY	SWTVGLPEEV	KIAEAYQMLK	KQGIVKSDPK
LPDDTTFPLP	PPRPKNVIFE	DEEKSKMLAR	LLKSSHPEDL	RAANKLIKEM
VQEDQKRMEK	ISKRVNAIEE	VNNNVKLLTE	MVMSHSQGGA	AAGSSEDLMK
ELYQRCERMR	PTLFRLASDT	EDNDEALAEI	LQANDNLTQV	INLYKQLVRG
EEVNGDATAG	SIPGSTSALL	DLSGLDLPPA	GTTYPAMPTR	PGEQASPEQP
SASVSLLDDE	LMSLGLSDPT	PPSGPSLDGT	GWNSFQSSDA	TEPPAPALAQ
APSMESRPPA	QTSLPASSGL	DDLDLLGKTL	LQQSLPPESQ	QVRWEKQQPT
PRLTLRDLQN	KSSSCSSPSS	SATSLLHTVS	PEPPRPPQQP	VPTELSLASI
TVPLESIKPS	NILPVTVYDQ	HGFRILFHFA	RDPLPGRSDV	LVVVVSMLST
APQPIRNIVF	QSAVPKVMKV	KLQPPSGTEL	PAFNPIVHPS	AITQVLLLAN
PQKEKVRLRY	KLTFTMGDQT	YNEMGDVDQF	PPPETWGSL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, апараті гольджі, ендосомах.

Література

Boman A.L., Zhang C.-J., Zhu X., Kahn R.A. (2000). A family of ADP-ribosylation factor effectors that can alter transport through the trans-Golgi. Mol. Biol. Cell. 11: 1241—1255. PMID 10749927 DOI:10.1091/mbc.11.4.1241
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Takatsu H., Yoshino K., Nakayama K. (2000). Adaptor gamma ear homology domain conserved in gamma-adaptin and GGA proteins that interact with gamma-synergin. Biochem. Biophys. Res. Commun. 271: 719—725. PMID 10814529 DOI:10.1006/bbrc.2000.2700
Puertollano R., Randazzo P.A., Presley J.F., Hartnell L.M., Bonifacino J.S. (2001). The GGAs promote ARF-dependent recruitment of clathrin to the TGN. Cell. 105: 93—102. PMID 11301005 DOI:10.1016/S0092-8674(01)00299-9
Takatsu H., Katoh Y., Shiba Y., Nakayama K. (2001). Golgi-localizing, gamma-adaptin ear homology domain, ADP-ribosylation factor-binding (GGA) proteins interact with acidic dileucine sequences within the cytoplasmic domains of sorting receptors through their Vps27p/Hrs/STAM (VHS) domains. J. Biol. Chem. 276: 28541—28545. PMID 11390366 DOI:10.1074/jbc.C100218200
Puertollano R., Aguilar R.C., Gorshkova I., Crouch R.J., Bonifacino J.S. (2001). Sorting of mannose 6-phosphate receptors mediated by the GGAs. Science. 292: 1712—1716. PMID 11387475 DOI:10.1126/science.1060750

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17842 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9UJY5 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.