CCNT1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2PK2, 3BLH, 3BLQ, 3BLR, 3LQ5, 3MI9, 3MIA, 3MY1, 3TN8, 3TNH, 3TNI, 4BCF, 4BCG, 4BCH, 4BCI, 4BCJ, 4EC8, 4EC9, 4IMY, 4OGR, 4OR5

Ідентифікатори

Символи

CCNT1, CCNT, CYCT1, HIVE1, cyclin T1

Зовнішні ІД

OMIM: 143055 MGI: 1328363 HomoloGene: 947 GeneCards: CCNT1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • snRNA binding • chromatin binding • 7SK snRNA binding • cyclin-dependent protein serine/threonine kinase regulator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase binding • transcription factor binding • protein serine/threonine kinase activity • protein kinase binding • GO:0016534 cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activator activity
Клітинна компонента	• нуклеоплазма • ядерце • cyclin/CDK positive transcription elongation factor complex • клітинне ядро • cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex
Біологічний процес	• regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • negative regulation of mRNA polyadenylation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • transcription by RNA polymerase II • поділ клітини • protein phosphorylation • positive regulation of phosphorylation of RNA polymerase II C-terminal domain • positive regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • positive regulation of viral transcription • клітинний цикл • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0022415 viral process • transcription, DNA-templated • snRNA transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of DNA-templated transcription, elongation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


904


12455

Ensembl


ENSG00000129315


ENSMUSG00000011960

UniProt


O60563


Q9QWV9

RefSeq (мРНК)


NM_001240 NM_001277842


NM_009833 NM_001368702

RefSeq (білок)


NP_001231 NP_001264771


NP_033963 NP_001355631

Локус (UCSC)

Хр. 12: 48.69 – 48.72 Mb

Хр. 15: 98.44 – 98.47 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CCNT1 (англ. Cyclin T1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 726 амінокислот, а молекулярна маса — 80 685^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEGERKNNNK	RWYFTREQLE	NSPSRRFGVD	PDKELSYRQQ	AANLLQDMGQ
RLNVSQLTIN	TAIVYMHRFY	MIQSFTQFPG	NSVAPAALFL	AAKVEEQPKK
LEHVIKVAHT	CLHPQESLPD	TRSEAYLQQV	QDLVILESII	LQTLGFELTI
DHPHTHVVKC	TQLVRASKDL	AQTSYFMATN	SLHLTTFSLQ	YTPPVVACVC
IHLACKWSNW	EIPVSTDGKH	WWEYVDATVT	LELLDELTHE	FLQILEKTPN
RLKRIWNWRA	CEAAKKTKAD	DRGTDEKTSE	QTILNMISQS	SSDTTIAGLM
SMSTSTTSAV	PSLPVSEESS	SNLTSVEMLP	GKRWLSSQPS	FKLEPTQGHR
TSENLALTGV	DHSLPQDGSN	AFISQKQNSK	SVPSAKVSLK	EYRAKHAEEL
AAQKRQLENM	EANVKSQYAY	AAQNLLSHHD	SHSSVILKMP	IEGSENPERP
FLEKADKTAL	KMRIPVAGGD	KAASSKPEEI	KMRIKVHAAA	DKHNSVEDSV
TKSREHKEKH	KTHPSNHHHH	HNHHSHKHSH	SQLPVGTGNK	RPGDPKHSSQ
TSNLAHKTYS	LSSSFSSSSS	TRKRGPSEET	GGAVFDHPAK	IAKSTKSSSL
NFSFPSLPTM	GQMPGHSSDT	SGLSFSQPSC	KTRVPHSKLD	KGPTGANGHN
TTQTIDYQDT	VNMLHSLLSA	QGVQPTQPTA	FEFVRPYSDY	LNPRSGGISS
RSGNTDKPRP	PPLPSEPPPP	LPPLPK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, поділ клітини, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

Wei P., Garber M.E., Fang S.-M., Fischer W.H., Jones K.A. (1998). A novel CDK9-associated C-type cyclin interacts directly with HIV-1 Tat and mediates its high-affinity, loop-specific binding to TAR RNA. Cell. 92: 451—462. PMID 9491887 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80939-3
Peng J.-M., Zhu Y., Milton J.T., Price D.H. (1998). Identification of multiple cyclin subunits of human P-TEFb. Genes Dev. 12: 755—762. PMID 9499409 DOI:10.1101/gad.12.5.755
Parada C.A., Roeder R.G. (1999). A novel RNA polymerase II-containing complex potentiates Tat-enhanced HIV-1 transcription. EMBO J. 18: 3688—3701. PMID 10393184 DOI:10.1093/emboj/18.13.3688
Kwak Y.T., Ivanov D., Guo J., Nee E., Gaynor R.B. (1999). Role of the human and murine cyclin T proteins in regulating HIV-1 Tat-activation. J. Mol. Biol. 288: 57—69. PMID 10329126 DOI:10.1006/jmbi.1999.2664
Fong Y.W., Zhou Q. (2000). Relief of two built-In autoinhibitory mechanisms in P-TEFb is required for assembly of a multicomponent transcription elongation complex at the human immunodeficiency virus type 1 promoter. Mol. Cell. Biol. 20: 5897—5907. PMID 10913173 DOI:10.1128/MCB.20.16.5897-5907.2000
Young T.M., Wang Q., Pe'ery T., Mathews M.B. (2003). The human I-mfa domain-containing protein, HIC, interacts with cyclin T1 and modulates P-TEFb-dependent transcription. Mol. Cell. Biol. 23: 6373—6384. PMID 12944466 DOI:10.1128/MCB.23.18.6373-6384.2003

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1599 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O60563 (англ.) . Архів оригіналу за 9 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.