APOBEC3B |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 5CQD, 5CQH, 5CQI, 5CQK, 2NBQ | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | APOBEC3B, A3B, APOBEC1L, ARCD3, ARP4, DJ742C19.2, PHRBNL, bK150C2.2, apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3B |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607110 MGI: 1933111 HomoloGene: 105420 GeneCards: APOBEC3B |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in cyclic amidines • zinc ion binding • каталітична активність • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • deoxycytidine deaminase activity • RNA binding • cytidine deaminase activity |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • цитоплазма |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of transposition • вроджений імунітет • процес імунної системи • defense response to virus • cytidine deamination • cytidine to uridine editing • DNA demethylation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_001160415 NM_030255 NM_001347041 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_001153887 NP_001333970 NP_084531 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 22: 38.98 – 38.99 Mb | Хр. 15: 79.78 – 79.8 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
APOBEC3B (англ. Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 382 амінокислот, а молекулярна маса — 45 924[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MNPQIRNPME | | RMYRDTFYDN | | FENEPILYGR | | SYTWLCYEVK | | IKRGRSNLLW |
DTGVFRGQVY | | FKPQYHAEMC | | FLSWFCGNQL | | PAYKCFQITW | | FVSWTPCPDC |
VAKLAEFLSE | | HPNVTLTISA | | ARLYYYWERD | | YRRALCRLSQ | | AGARVTIMDY |
EEFAYCWENF | | VYNEGQQFMP | | WYKFDENYAF | | LHRTLKEILR | | YLMDPDTFTF |
NFNNDPLVLR | | RRQTYLCYEV | | ERLDNGTWVL | | MDQHMGFLCN | | EAKNLLCGFY |
GRHAELRFLD | | LVPSLQLDPA | | QIYRVTWFIS | | WSPCFSWGCA | | GEVRAFLQEN |
THVRLRIFAA | | RIYDYDPLYK | | EALQMLRDAG | | AQVSIMTYDE | | FEYCWDTFVY |
RQGCPFQPWD | | GLEEHSQALS | | GRLRAILQNQ | | GN |
Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, антивірусний захист. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Rose K.M., Marin M., Kozak S.L., Kabat D. (2005). Regulated production and anti-HIV type 1 activities of cytidine deaminases APOBEC3B, 3F, and 3G. AIDS Res. Hum. Retroviruses. 21: 611—619. PMID 16060832 DOI:10.1089/aid.2005.21.611
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Wedekind J.E., Dance G.S.C., Sowden M.P., Smith H.C. (2003). Messenger RNA editing in mammals: new members of the APOBEC family seeking roles in the family business. Trends Genet. 19: 207—216. PMID 12683974 DOI:10.1016/S0168-9525(03)00054-4
- Hakata Y., Landau N.R. (2006). Reversed functional organization of mouse and human APOBEC3 cytidine deaminase domains. J. Biol. Chem. 281: 36624—36631. PMID 17020885 DOI:10.1074/jbc.M604980200
- Wichroski M.J., Robb G.B., Rana T.M. (2006). Human retroviral host restriction factors APOBEC3G and APOBEC3F localize to mRNA processing bodies. PLoS Pathog. 2: E41—E41. PMID 16699599 DOI:10.1371/journal.ppat.0020041
- Chiu Y.L., Greene W.C. (2008). The APOBEC3 cytidine deaminases: an innate defensive network opposing exogenous retroviruses and endogenous retroelements. Annu. Rev. Immunol. 26: 317—353. PMID 18304004 DOI:10.1146/annurev.immunol.26.021607.090350
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17352 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q9UH17 (англ.) . Архів оригіналу за 17 лютого 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |