прото-онкоген RET |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2IVS, 2IVT, 2IVU, 2IVV, 2X2K, 2X2L, 2X2M, 2X2U, 4CKI, 4CKJ, 4UX8, 5AMN | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | RET, Ret, PTC, RET51, RET9, c-Ret, CDHF12, CDHR16, HSCR1, MEN2A, MEN2B, MTC1, RET-ELE1, ret proto-oncogene |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 164761 MGI: 97902 HomoloGene: 7517 GeneCards: RET |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
колоректальний рак, familial medullary thyroid carcinoma, Множинна ендокринна неоплазія тип 2Б, феохромоцитома, множинна ендокринна неоплазія тип 2А, hereditary pheochromocytoma-paraganglioma, adrenal gland pheochromocytoma, Медулярний рак щитоподібної залози[1] |
|
Реагує на сполуку |
---|
linifanib, ponatinib, сорафеніб, сунітиніб, vandetanib[2] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • transferase activity • nucleotide binding • calcium ion binding • protein kinase activity • kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein tyrosine kinase activity • ATP binding • signaling receptor activity • transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity • receptor tyrosine kinase • transmembrane signaling receptor activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • ендосома • внутрішньоклітинна мембранна органела • мембрана • receptor complex • integral component of plasma membrane • аксон • neuronal cell body • дендрит (нейробіологія) • early endosome • membrane raft • endosome membrane • клітинна мембрана • гіалоплазма • plasma membrane protein complex • цитоплазма |
---|
Біологічний процес | • cellular response to retinoic acid • ureteric bud development • embryonic epithelial tube formation • membrane protein proteolysis • фосфорилювання • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway • positive regulation of cell migration • neuron cell-cell adhesion • нейробіологія розвитку • neuron maturation • positive regulation of metanephric glomerulus development • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • regulation of axonogenesis • protein phosphorylation • enteric nervous system development • positive regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand • regulation of cell adhesion • lymphocyte migration into lymphoid organs • адгезія клітин • GO:1901313 positive regulation of gene expression • ureter maturation • response to pain • retina development in camera-type eye • neural crest cell migration • neuron differentiation • positive regulation of cell size • positive regulation of neuron projection development • posterior midgut development • positive regulation of cell adhesion mediated by integrin • іннервація • positive regulation of neuron maturation • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • GO:0072468 сигнальна трансдукція • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • Peyer's patch morphogenesis • peptidyl-tyrosine phosphorylation • MAPK cascade • axon guidance • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation of STAT protein • glial cell-derived neurotrophic factor receptor signaling pathway • positive regulation of MAPK cascade • positive regulation of protein kinase B signaling • negative regulation of signal transduction • диференціація клітин • negative regulation of apoptotic process • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • Нейрогенез |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_000323 NM_020629 NM_020630 NM_020975 NM_001355216 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_065681 NP_066124 NP_001342145 NP_066124.1 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 10: 43.08 – 43.13 Mb | Хр. 6: 118.13 – 118.17 Mb |
---|
PubMed search | [3] | [4] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
Прото-онкоген RET (англ. Ret proto-oncogene) – білок, який кодується геном RET, розташованим у людини на довгому плечі 10-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 114 амінокислот, а молекулярна маса — 124 319[6]. Цей білок належить до рецепторних тирозинкіназ, членів GDNF-родини лігандів (англ. glial cell line-derived neurotrophic factor family). RET знаходиться в позаклітинному просторі, девпливає на регуляцію сигнальних шляхів ERK, PI3K.[7]
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAKATSGAAG | | LRLLLLLLLP | | LLGKVALGLY | | FSRDAYWEKL | | YVDQAAGTPL |
LYVHALRDAP | | EEVPSFRLGQ | | HLYGTYRTRL | | HENNWICIQE | | DTGLLYLNRS |
LDHSSWEKLS | | VRNRGFPLLT | | VYLKVFLSPT | | SLREGECQWP | | GCARVYFSFF |
NTSFPACSSL | | KPRELCFPET | | RPSFRIRENR | | PPGTFHQFRL | | LPVQFLCPNI |
SVAYRLLEGE | | GLPFRCAPDS | | LEVSTRWALD | | REQREKYELV | | AVCTVHAGAR |
EEVVMVPFPV | | TVYDEDDSAP | | TFPAGVDTAS | | AVVEFKRKED | | TVVATLRVFD |
ADVVPASGEL | | VRRYTSTLLP | | GDTWAQQTFR | | VEHWPNETSV | | QANGSFVRAT |
VHDYRLVLNR | | NLSISENRTM | | QLAVLVNDSD | | FQGPGAGVLL | | LHFNVSVLPV |
SLHLPSTYSL | | SVSRRARRFA | | QIGKVCVENC | | QAFSGINVQY | | KLHSSGANCS |
TLGVVTSAED | | TSGILFVNDT | | KALRRPKCAE | | LHYMVVATDQ | | QTSRQAQAQL |
LVTVEGSYVA | | EEAGCPLSCA | | VSKRRLECEE | | CGGLGSPTGR | | CEWRQGDGKG |
ITRNFSTCSP | | STKTCPDGHC | | DVVETQDINI | | CPQDCLRGSI | | VGGHEPGEPR |
GIKAGYGTCN | | CFPEEEKCFC | | EPEDIQDPLC | | DELCRTVIAA | | AVLFSFIVSV |
LLSAFCIHCY | | HKFAHKPPIS | | SAEMTFRRPA | | QAFPVSYSSS | | GARRPSLDSM |
ENQVSVDAFK | | ILEDPKWEFP | | RKNLVLGKTL | | GEGEFGKVVK | | ATAFHLKGRA |
GYTTVAVKML | | KENASPSELR | | DLLSEFNVLK | | QVNHPHVIKL | | YGACSQDGPL |
LLIVEYAKYG | | SLRGFLRESR | | KVGPGYLGSG | | GSRNSSSLDH | | PDERALTMGD |
LISFAWQISQ | | GMQYLAEMKL | | VHRDLAARNI | | LVAEGRKMKI | | SDFGLSRDVY |
EEDSYVKRSQ | | GRIPVKWMAI | | ESLFDHIYTT | | QSDVWSFGVL | | LWEIVTLGGN |
PYPGIPPERL | | FNLLKTGHRM | | ERPDNCSEEM | | YRLMLQCWKQ | | EPDKRPVFAD |
ISKDLEKMMV | | KRRDYLDLAA | | STPSDSLIYD | | DGLSEEETPL | | VDCNNAPLPR |
ALPSTWIENK | | LYGMSDPNWP | | GESPVPLTRA | | DGTNTGFPRY | | PNDSVYANWM |
LSPSAAKLMD | | TFDS |
Ген
Ген RET розташований на короткому плечі 10-ї хромосоми на позиції 11.2 (10q11.2), складається з 21 екзону. Різноманітні аномалії (транслокації (перестановки), мутації), що можуть виникати в RET, часто спостерігаються при медулярній та папілярній карциномах щитоподібної залози, феохромоцитомі та гіперплазії паращитоподібних залоз[8].
Роль RET під час розвитку організму
Трансдукція сигналів RET відіграє важливу роль в нормальному розвитку нирки та ентеральної нервової системи[9], частини периферійної нервової системи, яка регулює діяльність гладенької мускулатури.
Див. також
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Takahashi M., Cooper G.M. (1987). ret transforming gene encodes a fusion protein homologous to tyrosine kinases. Mol. Cell. Biol. 7: 1378—1385. PMID 3037315 DOI:10.1128/MCB.7.4.1378
- Corvi R., Berger N., Balczon R., Romeo G. (2000). RET/PCM-1: a novel fusion gene in papillary thyroid carcinoma. Oncogene. 19: 4236—4242. PMID 10980597 DOI:10.1038/sj.onc.1203772
- Klugbauer S., Rabes H.M. (1999). The transcription coactivator HTIF1 and a related protein are fused to the RET receptor tyrosine kinase in childhood papillary thyroid carcinomas. Oncogene. 18: 4388—4393. PMID 10439047 DOI:10.1038/sj.onc.1202824
- Graham Robinett R., Freemerman A.J., Skinner M.A., Shewchuk L., Lackey K. (2007). The discovery of substituted 4-(3-hydroxyanilino)-quinolines as potent RET kinase inhibitors. Bioorg. Med. Chem. Lett. 17: 5886—5893. PMID 17884497 DOI:10.1016/j.bmcl.2007.07.104
- Tsui C.C., Pierchala B.A. (2008). CD2AP and Cbl-3/Cbl-c constitute a critical checkpoint in the regulation of ret signal transduction. J. Neurosci. 28: 8789—8800. PMID 18753381 DOI:10.1523/JNEUROSCI.2738-08.2008
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з прото-онкоген RET переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Прото-онкоген RET переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9967 (англ.) . Архів оригіналу за 3 травня 2018. Процитовано 26 квітня 2018.
- ↑ UniProt, P07949 (англ.) . Архів оригіналу за 3 травня 2018. Процитовано 26 квітня 2018.
- ↑ Knowles PP, Murray-Rust J. та ін. (2006). Structure and chemical inhibition of the RET tyrosine kinase domain. J. Biol. Chem. 281 (44): 33577—87. doi:10.1074/jbc.M605604200. PMID 16928683.
{{cite journal}}
: Явне використання «та ін.» у: |author=
(довідка)Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання) - ↑ База даних хвороб, які пов'язані з аномаліями в RET. Архів оригіналу за 14 серпня 2021. Процитовано 28 березня 2012.
- ↑ Arighi E, Borrello MG, Sariola H. (2005). RET tyrosine kinase signaling in development and cancer. Cytokine Growth Factor Rev. 16 (4–5): 441—67. doi:10.1016/j.cytogfr.2005.05.010. PMID 15982921.
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |