RFC3

Replikacioni faktor C (aktivator 1) 3, 38kDa
Идентификатори
Симболи RFC3; RFC38
Вањски ИД OMIM: 600405 MGI: 1916513 HomoloGene: 2188 GeneCards: RFC3 Gene
Онтологија гена
Молекулска функција • nukleotidno vezivanje
• DNK vezivanje
• aktivnost postavljača DNK stege
Ћелијска компонента • nukleoplazma
• kompleks DNK replikacionog faktora C
Биолошки процес • kontrolno mesto ćelijskog ciklusa
• S faza mitotičkog ćelijskog ciklusa
• mitotički ćelijski ciklus
Преглед РНК изражавања
подаци
Ортолози
Врста Човек Миш
Ентрез 5983 69263
Eнсембл ENSG00000133119 ENSMUSG00000033970
UниПрот P40938 Q8R323
Реф. Секв. (иРНК) NM_002915 NM_027009
Реф. Секв. (протеин) NP_002906 NP_081285
Локација (УЦСЦ) Chr 13:
34.39 - 34.54 Mb		 Chr 5:
151.64 - 151.65 Mb
ПубМед претрага [1] [2]

Репликациони фактор Ц, подјединица 3 је протеин који је код људи кодиран RFC3 геном[1][2].

За елонгацију прајмираног ДНК шаблона ДНК полимеразе делта и ДНК полимеразе епсилон неопходни су помоћни протеини: пролиферативни ћелијски нуклеарни антиген (PCNA) и репликациони фактор Ц (РФЦ). РФЦ, такође познат као активатор 1, је протеински комплекс који се састоји од пет подјединица са 140, 40, 38, 37, и 36 kDa. Овај ген кодира 38 кДа подједницу. Та подјединица је есенцијална за интеракцију између 140 kDа подјединице и сржи комплекса која се састоји од 36, 37, и 40 kDa подјединица. Познате су алтернативно сплајсоване трансцриптне варијанте које кодирају различите изоформе[2].

Интеракције

RFC3 формира интеракције са BRD4,[3] CHTF18,[4][5] RFC1,[6][7][8] PCNA[5][9] i RFC4.[6][7]

Референце

  1. ^ Okumura K; Nogami M; Taguchi H; Dean FB; Chen M; Pan ZQ; Hurwitz J; Shiratori A; Murakami Y; Ozawa K; et al. (јул 1995). „Assignment of the 36.5-kDa (RFC5), 37-kDa (RFC4), 38-kDa (RFC3), and 40-kDa (RFC2) subunit genes of human replication factor C to chromosome bands 12q24.2-q24.3, 3q27, 13q12.3-q13, and 7q11.23”. Genomics. 25 (1): 274—8. PMID 7774928. doi:10.1016/0888-7543(95)80135-9. 
  2. ^ а б „Entrez Gene: RFC3 replication factor C (activator 1) 3, 38kDa”. 
  3. ^ Maruyama, Tetsuo; Farina Andrea; et al. (2002). „A Mammalian bromodomain protein, brd4, interacts with replication factor C and inhibits progression to S phase”. Mol. Cell. Biol. United States. 22 (18): 6509—20. ISSN 0270-7306. PMC 135621 Слободан приступ. PMID 12192049. doi:10.1128/MCB.22.18.6509-6520.2002. 
  4. ^ Bermudez, Vladimir P; Maniwa Yoshimasa; et al. (2003). „The alternative Ctf18-Dcc1-Ctf8-replication factor C complex required for sister chromatid cohesion loads proliferating cell nuclear antigen onto DNA”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. United States. 100 (18): 10237—42. ISSN 0027-8424. PMC 193545 Слободан приступ. PMID 12930902. doi:10.1073/pnas.1434308100. 
  5. ^ а б Merkle, Carolin J; Karnitz Larry M; et al. (2003). „Cloning and characterization of hCTF18, hCTF8, and hDCC1. Human homologs of a Saccharomyces cerevisiae complex involved in sister chromatid cohesion establishment”. J. Biol. Chem. United States. 278 (32): 30051—6. ISSN 0021-9258. PMID 12766176. doi:10.1074/jbc.M211591200. 
  6. ^ а б Ellison, V; Stillman B (1998). „Reconstitution of recombinant human replication factor C (RFC) and identification of an RFC subcomplex possessing DNA-dependent ATPase activity”. J. Biol. Chem. UNITED STATES. 273 (10): 5979—87. ISSN 0021-9258. PMID 9488738. doi:10.1074/jbc.273.10.5979. 
  7. ^ а б Uhlmann, F; Cai J; et al. (1996). „In vitro reconstitution of human replication factor C from its five subunits”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. UNITED STATES. 93 (13): 6521—6. ISSN 0027-8424. PMC 39056 Слободан приступ. PMID 8692848. doi:10.1073/pnas.93.13.6521. 
  8. ^ Tomida, Junya; Masuda Yuji; et al. (2008). „DNA damage-induced ubiquitylation of RFC2 subunit of replication factor C complex”. J. Biol. Chem. United States. 283 (14): 9071—9. ISSN 0021-9258. PMC 2431014 Слободан приступ. PMID 18245774. doi:10.1074/jbc.M709835200. 
  9. ^ Ohta, Satoshi; Shiomi Yasushi; et al. (2002). „A proteomics approach to identify proliferating cell nuclear antigen (PCNA)-binding proteins in human cell lysates. Identification of the human CHL12/RFCs2-5 complex as a novel PCNA-binding protein”. J. Biol. Chem. United States. 277 (43): 40362—7. ISSN 0021-9258. PMID 12171929. doi:10.1074/jbc.M206194200. 

Литература

  • Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides.”. Gene. 138 (1-2): 171—4. PMID 8125298. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. 
  • O'Donnell M; Onrust R; Dean FB; et al. (1993). „Homology in accessory proteins of replicative polymerases--E. coli to humans.”. Nucleic Acids Res. 21 (1): 1—3. PMC 309057 Слободан приступ. PMID 8441605. doi:10.1093/nar/21.1.1. 
  • Uhlmann F; Cai J; Flores-Rozas H; et al. (1996). „In vitro reconstitution of human replication factor C from its five subunits.”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93 (13): 6521—6. PMC 39056 Слободан приступ. PMID 8692848. doi:10.1073/pnas.93.13.6521. 
  • Uhlmann F; Cai J; Gibbs E; et al. (1997). „Deletion analysis of the large subunit p140 in human replication factor C reveals regions required for complex formation and replication activities.”. J. Biol. Chem. 272 (15): 10058—64. PMID 9092549. doi:10.1074/jbc.272.15.10058. 
  • Cujec TP; Cho H; Maldonado E; et al. (1997). „The human immunodeficiency virus transactivator Tat interacts with the RNA polymerase II holoenzyme.”. Mol. Cell. Biol. 17 (4): 1817—23. PMC 232028 Слободан приступ. PMID 9121429. 
  • Cai J; Gibbs E; Uhlmann F; et al. (1997). „A complex consisting of human replication factor C p40, p37, and p36 subunits is a DNA-dependent ATPase and an intermediate in the assembly of the holoenzyme.”. J. Biol. Chem. 272 (30): 18974—81. PMID 9228079. doi:10.1074/jbc.272.30.18974. 
  • Suzuki Y; Yoshitomo-Nakagawa K; Maruyama K; et al. (1997). „Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library.”. Gene. 200 (1-2): 149—56. PMID 9373149. doi:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. 
  • Ellison V, Stillman B (1998). „Reconstitution of recombinant human replication factor C (RFC) and identification of an RFC subcomplex possessing DNA-dependent ATPase activity.”. J. Biol. Chem. 273 (10): 5979—87. PMID 9488738. doi:10.1074/jbc.273.10.5979. 
  • Zhang G; Gibbs E; Kelman Z; et al. (1999). „Studies on the interactions between human replication factor C and human proliferating cell nuclear antigen.”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96 (5): 1869—74. PMC 26703 Слободан приступ. PMID 10051561. doi:10.1073/pnas.96.5.1869. 
  • Rauen M, Burtelow MA, Dufault VM, Karnitz LM (2000). „The human checkpoint protein hRad17 interacts with the PCNA-like proteins hRad1, hHus1, and hRad9.”. J. Biol. Chem. 275 (38): 29767—71. PMID 10884395. doi:10.1074/jbc.M005782200. 
  • Lindsey-Boltz LA, Bermudez VP, Hurwitz J, Sancar A (2001). „Purification and characterization of human DNA damage checkpoint Rad complexes.”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98 (20): 11236—41. PMC 58713 Слободан приступ. PMID 11572977. doi:10.1073/pnas.201373498. 
  • Griffith JD, Lindsey-Boltz LA, Sancar A (2002). „Structures of the human Rad17-replication factor C and checkpoint Rad 9-1-1 complexes visualized by glycerol spray/low voltage microscopy.”. J. Biol. Chem. 277 (18): 15233—6. PMID 11907025. doi:10.1074/jbc.C200129200. 
  • Ohta S; Shiomi Y; Sugimoto K; et al. (2002). „A proteomics approach to identify proliferating cell nuclear antigen (PCNA)-binding proteins in human cell lysates. Identification of the human CHL12/RFCs2-5 complex as a novel PCNA-binding protein.”. J. Biol. Chem. 277 (43): 40362—7. PMID 12171929. doi:10.1074/jbc.M206194200. 
  • Maruyama T; Farina A; Dey A; et al. (2002). „A Mammalian bromodomain protein, brd4, interacts with replication factor C and inhibits progression to S phase.”. Mol. Cell. Biol. 22 (18): 6509—20. PMC 135621 Слободан приступ. PMID 12192049. doi:10.1128/MCB.22.18.6509-6520.2002. 
  • Strausberg RL; Feingold EA; Grouse LH; et al. (2003). „Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences.”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899—903. PMC 139241 Слободан приступ. PMID 12477932. doi:10.1073/pnas.242603899. 
  • Merkle CJ, Karnitz LM, Henry-Sánchez JT, Chen J (2003). „Cloning and characterization of hCTF18, hCTF8, and hDCC1. Human homologs of a Saccharomyces cerevisiae complex involved in sister chromatid cohesion establishment.”. J. Biol. Chem. 278 (32): 30051—6. PMID 12766176. doi:10.1074/jbc.M211591200. 
  • Bermudez VP; Maniwa Y; Tappin I; et al. (2003). „The alternative Ctf18-Dcc1-Ctf8-replication factor C complex required for sister chromatid cohesion loads proliferating cell nuclear antigen onto DNA.”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100 (18): 10237—42. PMC 193545 Слободан приступ. PMID 12930902. doi:10.1073/pnas.1434308100. 
  • Zou L, Liu D, Elledge SJ (2004). „Replication protein A-mediated recruitment and activation of Rad17 complexes.”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100 (24): 13827—32. PMC 283506 Слободан приступ. PMID 14605214. doi:10.1073/pnas.2336100100. 
  • Ota T; Suzuki Y; Nishikawa T; et al. (2004). „Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs.”. Nat. Genet. 36 (1): 40—5. PMID 14702039. doi:10.1038/ng1285.