Micromonosporaceae
Micromonosporaceae | |
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Actinoplanes utahensis on agar plate | |
Scientific classification | |
Domain: | Bacteria |
Phylum: | Actinomycetota |
Class: | Actinomycetia |
Order: | Micromonosporales Genilloud 2015[1] |
Family: | Micromonosporaceae Krasil'nikov 1938 (Approved Lists 1980) |
Type genus | |
Micromonospora Ørskov 1923 (Approved Lists 1980) | |
Genera | |
See text. | |
Synonyms | |
Synonyms of Micromonosporales
Synonyms of Micromonosporaceae
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Micromonosporaceae is a family of bacteria of the class Actinomycetia. They are gram-positive, spore-forming soil organisms that form a true mycelium.
Phylogeny
The currently accepted taxonomy is based on the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)[2] and National Center for Biotechnology Information (NCBI).[3]
Whole-genome based phylogeny[4][a] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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16S rRNA based LTP_08_2023[5][6][7] | 120 marker proteins based GTDB 08-RS214[8][9][10] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Genera incertae sedis:
- "Solwaraspora" Magarvey et al. 2004[11]
Notes
- ^ Actinorhabdospora, Allocatelliglobosispora, Allorhizocola, Catellatospora, Couchioplanes, Krasilnikovia, Luedemannella, Mangrovihabitans, Phytohabitans, Phytomonospora, Pilimelia, Planosporangium, Plantactinospora, Polymorphospora, Rhizocola, Rugosimonospora, Spirilliplanes, and Virgisporangium are not included in this phylogenetic tree.
See also
References
- ^ Genilloud O (2012). "Order XI Micromonosporales ord. nov.". In Goodfellow M, Kämpfer P, Trujillo ME, Suzuki K, Ludwig W, Whitman WB (eds.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Vol. 5 (2nd ed.). New York: Springer. p. 1035.
- ^ Euzéby JP, Parte AC. "Micromonosporaceae". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Retrieved June 17, 2022.
- ^ Sayers; et al. "Micromonosporales". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Retrieved 2023-12-20.
- ^ Nouioui I, Carro L, García-López M, Meier-Kolthoff JP, Woyke T, Kyrpides NC, Pukall R, Klenk HP, Goodfellow M, Markus Göker M (2018). "Genome-Based Taxonomic Classification of the Phylum Actinobacteria". Front. Microbiol. 9: 2007. doi:10.3389/fmicb.2018.02007. PMC 6113628. PMID 30186281.
- ^ "The LTP". Retrieved 20 November 2023.
- ^ "LTP_all tree in newick format". Retrieved 20 November 2023.
- ^ "LTP_08_2023 Release Notes" (PDF). Retrieved 20 November 2023.
- ^ "GTDB release 08-RS214". Genome Taxonomy Database. Retrieved 10 May 2023.
- ^ "bac120_r214.sp_label". Genome Taxonomy Database. Retrieved 10 May 2023.
- ^ "Taxon History". Genome Taxonomy Database. Retrieved 10 May 2023.
- ^ Magarvey NA, Keller JM, Bernan V, Dworkin M, Sherman DH (2004). "Isolation and Characterization of Novel Marine-Derived Actinomycete Taxa Rich in Bioactive Metabolites". Applied and Environmental Microbiology. 70 (12): 7520–7529. Bibcode:2004ApEnM..70.7520M. doi:10.1128/AEM.70.12.7520-7529.2004. PMC 535209. PMID 15574955.
- v
- t
- e
- Domain
- Archaea
- Bacteria
- Eukaryota
- (major groups
- Excavata
- Diaphoretickes
- Hacrobia
- Cryptista
- Rhizaria
- Alveolata
- Stramenopiles
- Plants
- Hacrobia
- Amorphea
- Amoebozoa
- Opisthokonta
- Animals
- Fungi
- Mesomycetozoea)
BV1, BV3, BV5
others |
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Cyanoprokaryota |
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Firmicutes BV3 Low GC |
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- "Elulota"
- "Elulimicrobia"
- "Patescibacteria"
- ABY1
- "Absconditabacteria"
- "Andersenbacteria"
- "Berkelbacteria"
- "Dojkabacteria"
- "Doudnabacteria"
- "Gracilibacteria"
- "Howlettbacteria"
- "Katanobacteria"
- "Kazanbacteria"
- "Microgenomatia"
- "Paceibacteria"
- "Saccharimonadia"
- "Torokbacteria"
- "Wirthbacteria"
Synergistetes |
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Thermocalda |
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- Fusobacteriota
- Fusobacteriia
- "Macinerneyibacteriota"
- "Macinerneyibacteriia"
- "Muiribacteriota"
- "Muiribacteriia"
- "Rifleibacteriota"
- "Ozemibacteria"
- "Walliibacteriota"
BV2, BV4
Clade 1 |
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Clade 2 |
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Spirochaeto bacteriobiontes |
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PVC group (Planctobacteria) |
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FCB group (Sphingobacteria) |
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Proteobacteria BV2 |
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- "Qinglongiota"
- "Qinglongiia"
- "Salinosulfoleibacteria"
- "Teskebacteria"
- Source: Bergey's Manual (2001–2012)
- Alternative views: Wikispecies
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